ارزیابی تنوع ژنتیکی در جوجه گوشتی نژاد راس ۳۰۸ با استفاده از نشانگر ریزماهواره LEI۰۲۵۸
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: فصلنامه تحقیقات دامپزشکی، دوره: 77، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_JVR-77-3_006
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 288
نویسندگان
دانش آموخته دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران
گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران
گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه شیراز، شیراز، ایران
دانش آموخته دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران
چکیده
زمینه مطالعه: مجتمع عمده پذیرش بافتی (MHC) مولکول های بسیار متغیری را کدگذاری می کند که بیشتر آن ها مسئول تشخیص پادگن و فعال شدن پاسخ های ایمنی در میزبان هستند. یک نشانگر ژنتیکی مناسب برای تعیین هاپلوتیپ های MHCو تنوع ژنتیکی در طیور ریزماهواره LEI۰۲۵۸ است که در ناحیه MHC طیور قرار دارد.هدف: با توجه به این که تاکنون گزارشی مبنی بر فراوانی و انواع آللهای MHC و تحلیل ژنتیک جمعیت در طیور راس ۳۰۸ ایران در دست نیست، لذا هدف از مطالعه حاضر بررسی تنوع هاپلوتیپ های MHC جوجه های گوشتی نژاد راس ۳۰۸ توسط ریزماهواره LEI۰۲۵۸ است.روشکار: تعداد ۲۱۶ نمونه خون از دو گله مولد جوجه گوشتی نژاد راس ۳۰۸ تهیه شد. پس از استخراج DNA از نمونه های خون و افزوده سازی آلل های ریزماهواره LEI۰۲۵۸، ژنوتایپینگ هاپلوتیپ های MHC با استفاده از روش های آگارز ژل الکتروفورز و تحلیل قطعات (Fragment analysis) انجام شد.نتایج: در مجموع ۷ آلل و ۲۱ ژنوتیپ ریزماهواره LEI۰۲۵۸ در دو جمعیت شناسایی شدند. بیشترین فراوانی متعلق به آلل ۳۸۵ جفت باز (۸۶/۴۲ درصد) و کمترین فراوانی متعلق به آلل۳۰۰ جفت باز (۳۳/۴ درصد) بود. همچنین هتروزیگوت ۳۸۵/۲۰۷ ژنوتیپ غالب در هر دو جمعیت بود. در تحلیل ماتریکس تشابه، ۵۶/۸۴ درصد تشابه بین دو جمعیت مشاهده شد. نتیجهگیری نهایی: نتایج حاصل از مطالعه حاضر سطح بالایی از هتروزیگوسیتی (۷۱/۸۵ و ۳۵/۹۱ درصد) و انحراف از تعادل هاردی-وینبرگ (۰۰۰۱/۰P< ) را در هر دو جمعیت جوجه های گوشتی راس ۳۰۸ نشان داد. جمعیت های راس ۳۰۸ در مقایسه با جمعیت های بومی از تنوع آللی کم و تشابه ژنتیکی بالایی برخوردارند. این نتایج اطلاعات بیشتری در جهت استفاده ازMHC به عنوان یک نشانگر ژنی برای حفظ منابع و بهبود ژنتیکی در جمعیت جوجه های گوشتی فراهم می کند.کلیدواژه ها
پلی مورفیسم, جوجه گوشتی, ریزماهواره, مجتمع عمده پذیرش بافتی, LEI۰۲۵۸اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.