Transferability of wheat SSR markers for determination of genetic diversity and relationships of barley varieties
- سال انتشار: 1399
- محل انتشار: مجله فیزیولوژی و پرورش گیاهان، دوره: 10، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_BREDNG-10-2_008
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 434
نویسندگان
Department of Plant Breeding and Biotechnology, University of Tabriz, Tabriz, Iran.
Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran.
Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran.
Dryland Agriculture Research Institute of Iran, Maragheh, Iran.
چکیده
Simple sequence repeat (SSR) markers are simple PCR-based co-dominant markers, which are highly polymorphic and informative due to the number and frequency of alleles, and thus they are most utilized among the molecular markers. However, the development of SSR markers is costly and time-consuming. Cross-species transferability of SSRs allows the SSRs isolated from one species to apply on a closely related species, which increases the utility of previously isolated SSRs. This study demonstrated the cross-species transferability of ۱۹۶ SSR primer pairs of wheat in genetic diversity analysis of ۴۰ varieties of barley (Hordeum vulgare L.). Of the ۱۹۶ SSR primer pairs assayed, ۵۹ (۳۰.۱%) showed transferability. Of the ۵۹ primer pairs, ۲۱ pairs were polymorphic with the polymorphism information content ranging from ۰.۱۹ to ۰.۷۰. The number of alleles detected at each locus ranged from one to seven with an average of ۳.۵۷. Cluster analysis using the Minimum Evolution algorithm and the coefficient of Number of Differences assigned the genotypes into five groups.کلیدواژه ها
Barley, SSR, Transferability, Wheatاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.