Investigating the effect of MSI-۹۹ antimicrobial peptide onMexAB-OprM efflux pump of Pseudomonas aeruginosa using moleculardocking

  • سال انتشار: 1401
  • محل انتشار: بیست و سومین کنگره بین المللی میکروب شناسی ایران
  • کد COI اختصاصی: MEDISM23_565
  • زبان مقاله: انگلیسی
  • تعداد مشاهده: 141
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

Zohreh Gholizadeh Siahmzgi

Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran

Mohaddeseh Mohsenpour

Department of Biology, North Tehran Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran

چکیده

Background and Aim : MSI-۹۹ is a Magainin antimicrobial peptide analogue derived from theAfrican clawed frog (Xenopus laevis) skin secretions. This peptide contains ۲۳ amino acids andhas antibiotic-like activity against microorganisms using ionophore properties. The purpose of thisstudy is investigation the function of MSI-۹۹ peptide on MexAB-OprM efflux pump ofPseudomonas aeruginosa.Methods : Three-dimensional structure of MSI-۹۹ as ligand was modeled by I-TASSER serverand target protein (MexAB-OprM efflux pump) of Pseudomonas p.aeruginosa was collected fromProtein Data Bank according to ۶IOK (PDB ID). Finally, using Patchdock (ver. ۱.۳) the moleculardocking was studied. The clustering RMSD value was set to ۴Å.Results : Analysis of molecular docking indicates that MSI-۹۹ peptide has inhibitory potential tothe MexAB-OprM efflux pump and its binding energy is -۲۳.۷۶ kcal.mol-۱.Conclusion : According to our results, MSI-۹۹ peptide has inhibitory potential to efflux pump ofP.aeruginosa. Thus, it can be considered as an alternative inhibitor for the efflux pump inP.aeruginosa that is antbiotic resistance.

کلیدواژه ها

MSI-۹۹ peptide, Pseudomonas aeruginosa, Efflux pump, Molecular docking

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.