ارزیابی بیان ژن های ۳-۳-۱۴ در سیب زمینی تحت تنش خشکی
محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 14، شماره: 3
سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 132
فایل این مقاله در 20 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JOAGK-14-3_004
تاریخ نمایه سازی: 11 مهر 1401
چکیده مقاله:
هدف: سیبزمینی یک محصول زراعی و غذای مهم در جهان است. اما گیاه سیبزمینی به تنش خشکی حساس است. به همین دلیل برررسی مکانیسم مولکولی تحمل به تنش خشکی ضروری به نظر میرسد. پروتئین GF۱۴/۱۴-۳-۳ یکی از پروتئینهای دایمری محافظتشده هستند که چندین فرایند سلولی از متابولیسم تا انتقال، رشد و توسعه و پاسخ به تنش را تنظیم میکنند. اما گزارشهای کمی درباره ژنهای ۳-۳-۱۴ در سیب زمینی در دسترس است. مواد و روش ها: در این مطالعه، ۱۲ ژن در ژنوم سیبزمینی با استفاده از ابزار بیوانفورماتیک شناسایی شده است. علاوهبر این، آنالیز موتیف، ساختار ژن، آنالیز فیلوژنی، آنالیز جایگاه اتصال فاکتور رونویسی (TFBS) و سینتنی بر روی ژنهای ۳-۳-۱۴ انجام شد. همچنین آنالیز بیان دو ژن (StGF۱۴i و StGF۱۴h) در چهار بافت ریشه، ساقه، برگ و غده و بیان آنها تحت تنش خشکی در شرایط گلخانه بررسی شد. نتایج: بر اساس آنالیز فیلوژنتیکی، اعضای خانواده ژنی StGF۱۴ به دو کلاس تقسیمبندی شدند. آنالیز مکانهای اتصال فاکتور رونویسی (TFBS) در ناحیه پروموتری ژنهای ۳-۳-۱۴ نشان داد که بیشترین و کمترین تعداد TFBS به ترتیب مربوط به MYB و CSD میباشد. علاوه براین، فراوانی متفاوت TFBSها در ژنهای ۳-۳-۱۴ میتواند نشان دهنده این باشد که این ژنها در مراحل مختلف رشد و نمو و مکانیسمهای پیچیده تنظیمی درگیر هستند. روابط تکاملی سیبزمینی با استفاده از شناسایی ارتولوگ ها و پارالوگ ها مطالعه شد. تعداد اگزونها در ژنهای ۳-۳-۱۴ از ۴ تا ۷ متغیر بود و بیشتر این ژنها در زیر خانواده مشابه دارای الگوی اگزون-اینترون مشابه هستند. بیان دو ژن در برگ و غده تحت تنش خشکی و همچنین بیان هر دوژن در بافتهای ریشه، ساقه، برگ و غده مورد بررسی قرار گرفت. براساس آنالیز بیان دو ژن StGF۱۴i و StGF۱۴h در بافتها و بررسی تنش خشکی، ژن StGF۱۴i بیان بالاتری در چهار بافت داشته و همچنین بالاترین بیان را در غده تحت تنش خشکی سیبزمینی نشان داد. نتایج نشان داد که دو جفت ارتولوگ بین سیبزمینی و آرابیدوپسیس و همچنین ۸ جفت پارالوگ در ژنوم سیبزمینی وجود دارد. نتیجه گیری: الگوی بیان ژن هایStGF۱۴i و StGF۱۴h در بافتهای مختلف و در پاسخ به تنش خشکی نشان میدهد که این دو ژن نقشهای ضروری و محافظتشده در رشد و نمو سیبزمینی دارند. امید است که نتایج این مطالعه بتواند به بررسیهای بیشتر بر روی نقش عملکردی و مکانیسم مولکولی ژنهای ۳-۳-۱۴ در پاسخ به تنش خشکی در سیبزمینی کمک نماید.
نویسندگان
ژهرا حاجی برات
دانشگاه شهید بهشتی
عباس سعیدی
استاد بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران.
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :