عالیه کاظمی نژاد - گروه شیمی، دانشکده علوم پایه،واحد گرگان،دانشگاه آزاد اسلامی،گرگان، ایران
الهام تازیکه لمسکی - گروه شیمی، دانشکده علوم پایه،واحد گرگان،دانشگاه آزاد اسلامی،گرگان، ایران

بر هم کنش یون فلزی مس با آنزیم آلفا آمیلاز گرفته شده از ژن گاوی در دمای ۳۰۰ درجه کلوین با کمک محاسبات شبیه سازی دینامیک مولکولی بررسی شد. در این مطالعه ، چگونگی اتصال و برخی پارامتر های ترمودینامیکی مورد ارزیابی قرار گرفت . محاسبات برای دو حالت در حضور یون فلزی و در غیاب آن انجام گرفته و نتایج با کمک آنالیزهایی چون انحراف جذر مربع میانگین ، الگوریتم(تحلیل ساخنار دوم پروتیینی) dssp مورد بررسی قرار گرفت.

آلفا آمیلاز - شبیه سازی دینامیک مولکولی - انحراف جذر مربع - الگوریتم dssp