تعیین ویژگی های مولکولی و پراکنش جغرافیایی ویروس کوتولگی سبزرد نخود در ایران

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 27

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JAEN-87-1_012

تاریخ نمایه سازی: 22 شهریور 1401

چکیده مقاله:

ویروس کوتولگی سبزرد نخود (Chickpea chlorotic dwarf virus, CpCDV) از جنس Mastrevirus، تیره Geminiviridae، از مهمترین عوامل ویروسی همراه با عارضه زردی نخود می باشد. در سال­ های ۱۳۹۵-۱۳۹۴ تعداد ۲۴۸ نمونه نخود و عدس با نشانه زردی از پنج استان لرستان، کرمانشاه، زنجان، آذربایجان شرقی و غربی انتخاب و از طریق آزمون TBIA و PCR  بررسی شدند. استخراج دی­ان­ای از نمونه­ های آلوده انجام و از طریق روش دایره غلطان (RCA) تغلیظ و پس از هضم آنزیمی محصول (RCA) با استفاده از آنزیم برشی Xho I ، قطعات با اندازه حدود ۶/۲ کیلو جفت باز روی ژل آگاروز مشاهده شد. با استفاده از جفت آغازگر اختصاصی و انجام PCR، قطعه ۹۶۰ جفت بازی تکثیر و پس از همسانه سازی، تعیین ترادف گردید. نتایج آزمون TBIA و PCR نشان دهنده پراکنش ویروس CpCDV در هر پنج استان بود. بیشترین میزان آلودگی در میزبان نخود مشاهده شد. مقایسه ترادف قطعه ژنومی جدایه­ های ایرانی CpCDV نشانگر بیشترین یکسانی با سویه A، D و F از کشورهای هند، پاکستان و یمن بود. آنالیز تبارزائی نشانگر هم گروهی جدایه­های ایرانی با سویه های D (جدایه­ های سودان، مراکش، هند و پاکستان (گروه III تبارزائی)، سویه F (جدایه­ های سودان، عمان، سوریه، یمن و پاکستان (گروه IV تبارزائی) و سویه A  (جدایه های تونس، مصر، سوریه و ترکیه (گروه V تبارزائی ) بود.

کلیدواژه ها:

زردی نخود ، پراکنش جغرافیایی ، ویروس کوتولگی سبزرد نخود

نویسندگان

کاوه بنانج

بخش تحقیقات ویروس های گیاهی، موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، تهران

یلدا سخن سنج

گروه گیاهپزشکی، دانشکده علوم کشاورزی و صنایع غذایی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.

فرشاد رخشنده رو

عضو هیئت علمی گروه بیماری شناسی گیاهی دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران

علی آهون منش

استاد بازنشسته دانشگاه صنعتی اصفهان، دکتری و فوق­ تخصص گیاهپزشکی، از دانشگاه کالیفرنیا

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • AKHTAR, K. P., AHMAD, M., SHAH, T. M., ATTA, B. ...
  • AKHTAR, S., KHAN, A. J., BRIDDON, R. W. ۲۰۱۳. A ...
  • ANONYMOUS, ۲۰۱۷. Statistical annual report of Iranian agricultural crops. Ministry ...
  • FAHMY, I. F., TAHA, O., EL-ASHRY, A. N. ۲۰۱۵. First ...
  • FAOSTAT, ۲۰۱۴. Prunus production: National Agricultural statistics Service, USDA ...
  • FAO, ۲۰۱۴. FAOSTAT Database results from FAO website. Food and ...
  • FARZADFAR, S., POURRAHIM, R., GOLNARAGHI, A. R., AHOONMANESH, A. ۲۰۰۸. ...
  • FIALLO-OLIVE, E., MOHAMMED, I. U., TURAKI, A. A., MUHAMMAD, A., ...
  • HAMZA, M., TAHIR, M. N., MUSTAFA, R., KAMAL, H., KHAN, ...
  • HORN, N. M., REDDY, S. V., REDDY, D. V. R. ...
  • HORN, N. M., REDDY, S. V., REDDY, D. V. R. ...
  • HORN, N. M., REDDY, S. V., ROBERTS, I. M., REDDY, ...
  • HORN, N. M., REDDY, S. V., van den Huevel, J. ...
  • KANAKALA, S., KURIA, P. ۲۰۱۹. Chickpea chlorotic dwarf virus: An ...
  • KIMURA, M. ۱۹۸۰. A simple method for estimating evolutionary rate ...
  • KRABERGER, S., HARKINS, G. W., KUMARI, S.G., THOMAS, J. E., ...
  • KRABERGER, S., KUMARI, S. G., HAMED, A. A., GRONENBORN, B., ...
  • KUMARI, S. G., MAKKOUK, K. M., ATTAR, N., GHULAM, W. ...
  • MAKKOUK, K. M., COMEAUE, A. ۱۹۹۴. Evaluation of various methods ...
  • MAKKOUK, K. M., FAZLALI, Y., KUMARI, S. G., and FARZADFAR, ...
  • MAKKOUK, K. M., KUMARI, S. G., SHAHRAEEN, N., FAZLALI, Y., ...
  • MUMTAZ, H., KUMARI, S. G., MANSOOR, S., MARTIN, D. P., ...
  • NAHID, N., AMIN, I., MANSOOR, S., RYBICKI, E. P., VAN ...
  • SAITOU, N., NEI, M., ۱۹۸۷. The neighbour-joining method: A new ...
  • TAMURA, K., STECHER, G., PETERSON, D., FILIPSKI, A., KUMAR, S., ...
  • OUATTARA, A., TIENDREBEOGO, F., LEFEUVRE, P., HOAREAU, M., CLAVERIE, S., ...
  • OWOR, B. E., SHEPHERD, D. N., TAYLOR, N. J., EDEMA, ...
  • SHEPHERD, D. N., MARTIN, D. P., LEFEUVRE, P., MONJANE, A. ...
  • ZAAGUERI, T., MIOZZI, L., MNARI-HATTAB, M., NORIS, E., ACCOTTO, G. ...
  • ZIA-UR-REHMAN, M., HAMEED, U., ALI, C. A., HAIDER, M. S. ...