تعیین خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی جدایه های Pseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار در استان های خراسان رضوی و شمالی

باکتری Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss)عامل یکی از بیماری های شایع در باغ های درختان میوه هسته دار می باشد. به منظور شناسایی جدایه های عامل بیماری، طی سال های ۱۳۹۱-۱۳۹۰، ۲۳ جدایه به دست آمده از باغ های درختان میوه هسته دار واقع در مناطق مختلف استان های خراسان رضوی و شمالی از نظر فنوتیپی (فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی) و بیماری زایی مورد بررسی قرار گرفتند. جدایه ها از نظر ویژگی های فنوتیپی اختلافات جزئی نشان دادند. همه جدایه ها روی هلو و بادام دارای قدرت بیماری زایی بالایی بودند و از این نظر مشابه به نظر رسیدند. صحت تشخیص جدایه ها در سطح گونه توسط واکنش زنجیره ای پلیمراز و با استفاده از آغازگر های D۲۱/D۲۲ اختصاصی گونه مورد تایید قرار گرفت. تنوع ژنتیکی جدایه ها به دو روشrepetitive element palindromic PCR (rep-PCR) و با استفاده از آغازگر های BOXA۱R، ERIC۱R و ERIC۲ و روش Insertion Sequence PCR (IS-PCR) و با استفاده از آغازگر IS۵۰ مورد بررسی قرار گرفت. آنالیز خوشه ای نتایج به دست آمده نشان داد که در BOX-PCR با آغازگر BOXA۱Rدر سطح تشابه ۷۵ درصد، جدایه ها به ۷ گروه؛ در ERIC-PCR با آغازگر ERIC۱R در سطح تشابه ۶۵ درصد، جدایه ها به ۷ گروه و با آغازگر ERIC۲ در سطح تشابه ۵۶ درصد، جدایه ها به ۸ گروه؛ در IS-PCR با آغازگر IS۵۰ در سطح تشابه ۵۲ درصد، جدایه ها به ۱۱ گروه و در نهایت با ترکیب هر چهار آغازگر در سطح تشابه ۵۴ درصد جدایه ها به ۷ گروه قابل تفکیک هستند. نتایج بیانگر تنوع ژنتیکی بالا درون جدایه های عامل بیماری شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار در استان های مورد مطالعه است.

کلیدواژه ها:

شانکر باکتریایی ، تنوع ژنتیکی ، درختان میوه هسته دار ، rep-PCR ، IS-PCR