ارزیابی تفاوت ها و شباهت های ژنتیکی جمعیت ها و ژنوتیپ های بنگ دانه بر اساس نشانگرهای رتروترانسپوزونیIRAP و REMAP
عنوان مقاله: ارزیابی تفاوت ها و شباهت های ژنتیکی جمعیت ها و ژنوتیپ های بنگ دانه بر اساس نشانگرهای رتروترانسپوزونیIRAP و REMAP
شناسه ملی مقاله: JR_JWR-3-2_012
منتشر شده در در سال 1401
شناسه ملی مقاله: JR_JWR-3-2_012
منتشر شده در در سال 1401
مشخصات نویسندگان مقاله:
علیرضا اصغری میرک - مربی، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، مشگین شهر، اردبیل، ایران
سیدسیامک علوی کیا - دانشیار، گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
سید ابوالقاسم محمدی - استاد، گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
خلاصه مقاله:
علیرضا اصغری میرک - مربی، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، مشگین شهر، اردبیل، ایران
سیدسیامک علوی کیا - دانشیار، گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
سید ابوالقاسم محمدی - استاد، گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
بنگ دانه به دلیل آلکالوئیدهای هیوسیامین و اسکوپولامین از ارزش دارویی بالایی برخوردار است. تنوع ژنتیکی این گیاه با استفاده از نشانگرهای مختلف ارزیابی شده است. ولی تاکنون از کاربرد نشانگرهای رتروترانسپوزونی در بررسی تنوع ژنتیکی و بهبود کیفیت و کمیت آلکالوئیدهای این گیاه گزارشی ثبت نشده است. لذا در این پژوهش تنوع ژنتیکی۱۰ جمعیت بنگ دانه با استفاده از نشانگرهای مولکولی IRAP و REMAP بررسی شد. برای نشانگرهای IRAP از ۳۶ ترکیب ممکن حاصل از هشت آغازگرLTR، هفت ترکیب ، تکثیر مناسب و قابل امتیازدهی داشتند. در تکنیکREMAP از ترکیب ۱۱ آغازگر ISSRبا هشت آغازگر LTR استفاده شد که از ۸۸ ترکیب ممکن، ۱۲ ترکیب قابل امتیازدهی بودند. متوسط میزان اطلاعات چندشکلی برای نشانگرهای IRAP وREMAP به ترتیب ۳۰/۰ و ۳۲/۰ و میانگین شاخص نشانگر برای این دو نشانگر برابر ۵۹/۲ و ۴۷/۲ برآورد شد. بر اساس این معیارها، نشانگر REMAP به علت نقش بارزتر ریزماهواره ها در برآورد تنوع ژنتیکی بنگدانه کاراتر از IRAP بود. در تجزیه واریانس مولکولی با استفاده از نشانگرهای IRAP و REMAP تنوع درون جمعیتی بیشتر از بین جمعیتی برآورد شد که این امر می تواند ناشی از وجود تفاوتهای ژنتیکی زیاد در افراد درون جمعیت از لحاظ مکانهای ژنی تکثیر یافته باشد و مویدی بر ناهمگنی درون جمعیت و تنوع مطلوب این جمعیتها در شمال غرب ایران باشد. تجزیه خوشه ای بر اساس نشانگر IRAP موفق به تفکیک گونه ها از یکدیگر نبود ولی نشانگر REMAP توانست گونه های H.pusillus و H.reticulatus را تا حد بالایی از هم تفکیک کند.
کلمات کلیدی: بنگ دانه, تنوع ژنتیکی, نشانگر IRAP, نشانگر REMAP
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1509771/