مطالعه ی کل ژنوم بلدرچین ژاپنی با استفاده از رویکرد تک مرحله ای صفات مرتبط با بازده مصرف خوراک
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: فصلنامه تولیدات دامی، دوره: 24، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_JAP-24-2_001
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 130
نویسندگان
استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک.
دانشیار،گروه علومدامی،دانشکده کشاورزی و محیط زیست،دانشگاه اراک،اراک،ایران.
دانشیار،گروه علومدامی،دانشکده کشاورزی و محیط زیست،دانشگاه اراک،اراک،ایران.
چکیده
هدف از این مطالعه بررسی معماری ژنتیکی، شناسایی مناطق ژنومی و ژنهای کاندیدای مرتبط با صفات افزایش وزن بدن، میزان خوراک مصرفی و ضریب تبدیل خوراک در بلدرچین ژاپنی بود. برای شناسایی پنجرههای ژنومی اصلی، از روش مطالعه پویش کل ژنومی تک مرحلهای و از اطلاعات ژنومی ۹۲۰ قطعه بلدرچین ژاپنی استفاده شد. آنالیز پویش ژنومی بهوسیله نرمافزارهای خانواده BLUPF۹۰ انجام شد. نتایج براساس مقدار واریانس ژنتیکی افزایشی کنترل شده در قالب پنجرههای بهطور میانگین ۱/۵ مگابازی از SNPهای مجاور ارائه شد. پنجرههایی که بیش از یک درصد واریانس را کنترل میکردند به عنوان مناطق ژنومی موثر و برای یافتن ژنهای کاندیدا استفاده شدند. تعداد ۱۳ پنجره ژنومی معنیدار روی هشت کروموزوم، ۲۳ درصد کل واریانس ژنتیکی صفت افزایش وزن بدن را توجیه میکردند و حاوی ژنهای کاندیدای SMYD۱، ADGRG۶وCFL۲بودند. بیش ترین واریانس مربوط به پنجرهای روی کروموزوم شماره دو بود. تعداد ۲۰ پنجره روی هشت کروموزوم و شامل ژنهای کاندیدای ACSL۱،PPA۲ ، FGF۲ و RBL۲مرتبط با میزان خوراک مصرفی بودند. این پنجرهها ۳۸ درصد واریانس ژنتیکی را کنترل میکردند و مهمترین پنجره روی کروموزوم شماره چهار بود. هم چنین برای ضریب تبدیل خوراک تعداد ۱۲ منطقه ژنومی روی هفت کروموزوم، ۲۳/۷درصد از واریانس ژنتیکی را توجیه میکردند و حاوی ژنهای کاندیدای ATRNL۱و PTPN۴بود. نتایج نشان داد چهار منطقه ژنومی اثر پلیوتروپی دارند. باتوجه به شناسایی مناطق ژنومی جدیدونقش کلیدی ژنهای ذکرشده مرتبط با مصرف خوراک میتوان کارایی روش تک مرحله ای برای پویش ژنومی صفات بازده مصرف خوراک را تاییدکرد.کلیدواژه ها
بلدرچین ژاپنی, رویکرد تک مرحله ای, ژن کاندیدا, ضریب تبدیل خوراک, وزن بدناطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.