تنوع ژنتیکی جدایه های مختلف نوکلئوپلی هیدروویروس(HaNPV) در استان های مازندران و گلستان با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD.
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: فصلنامه گیاه پزشکی کاربردی، دوره: 3، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_PLNTI-3-2_004
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 230
نویسندگان
محققین مرکز تحقیقات و آموزش توتون تیرتاش، بهشهر، مازندران، ایران
محققین مرکز تحقیقات و آموزش توتون تیرتاش، بهشهر، ایران
محققین مرکز تحقیقات و آموزش توتون تیرتاش، بهشهر، ایران
محققین مرکز تحقیقات و آموزش توتون تیرتاش، بهشهر، ایران
چکیده
کرم غنچه توتون (Helicoverpa armigera) یکی از آفات مهم و کلیدی مزارع توتون محسوب می شود. ویروس چند وجهی هستهای (Nucleopolyhedrovirus) یکی از عوامل مهم کنترل بیولوژیک علیه کرم غنچه و تعدادی از گونههای دیگر می باشد. این تحقیق با هدف بررسی تنوع ژنتیکی جدایههای مختلف نوکلئوپلی هیدروویروس در ۱۶ جمعیت طبیعی استانهای مازندران و گلستان انجام شد. نمونههای کرم غنچه توتون آلوده به ویروس از مزارع توتون در استانهای مازندران و گلستان جمعآوری شدند. خالصسازی ویروس و استخراج DNA با استفاده از روش CTAB انجام شد. در آزمون نشانگرهای RAPD ابتدا از ده جفت آغازگر جهت تکثیر DNA ویروس NPV استفاده گردید که از بین آنها دو جفت آغازگر که بیشترین پلیمورفیسم را داشتند، انتخاب شدند. این دو جفت آغازگر روی ۱۶ نمونه DNA مربوط به جدایههای مناطق جغرافیایی مختلف بررسی شدند. دو جفت آغازگر مورد استفاده همگی نوارهای قابل کدگذاری ایجاد کردند. پس از الکتروفورز محصولات PCR، در مجموع تعداد ۸۷ باند قابل امتیازدهی به دست آمد که از بین آنها، ۷۵ باند (۸۶ درصد) دارای چندشکلی بودند. تجزیه و تحلیل دادهها با استفاده از نرم افزارPyElph انجام شد. پس از گروهبندی جمعیتها با روش UPGMA در فاصله ژنتیکی ۲۰، پنج شاخه اصلی مشاهده شد که این بیانگر وجود تنوع ژنتیکی میان جدایههای مورد بررسی بود، ولی این تنوع ژنتیکی با توزیع جغرافیایی جدایهها مطابقت زیادی نداشت. با مبنا قرار دادن نشانگرRAPD جدایههایی از نوکلئوپلی هیدروویروس با بیشترین قرابت ژنتیکی در یک خوشه ژنی قرار گرفتند و بیشترین شباهت را نشان دادند. نتایج ثابت کرد که بین جدایههای مطالعه شده تنوع خوبی وجود داشت که جهت برنامههای به نژادی و همچنین کنترل بیولوژیک میتوان از آنها استفاده نمود.کلیدواژه ها
کرم غنچه توتون, تنوع ژنتیکی, نشانگر RAPD, ویروس NPVاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.