شناسایی QTLهای پیوسته با ارتفاع بوته و زمان رسیدگی در برنج

  • سال انتشار: 1392
  • محل انتشار: فصلنامه علوم زراعی ایران، دوره: 15، شماره: 2
  • کد COI اختصاصی: JR_AGRO-15-2_002
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 173
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

میثم شیخ پور آهندانی

دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان

بابک ربیعی

دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان

رضا شیرزادیان خرم آباد

دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان

چکیده

هدف از این تحقیق، شناسایی نشانگرهای ریزماهواره (SSR) و AFLP پیوسته با صفات ارتفاع بوته و زمان رسیدگی در یک جمعیت ۱۸۸ فردی F۲:۳ حاصل از تلاقی ارقام برنج بینام و کادوس به منظور استفاده از آنها در برنامه های انتخاب به کمک نشانگر و هرمی نمودن ژن ها (QTL ها) برای کاهش ارتفاع بوته و زمان رسیدگی در نتاج حاصل بود که در سال ۱۳۸۸ در دانشکده کشاورزی دانشگاه گیلان اجرا شد. از بین نشانگرهای SSR و AFLPمورد استفاده در این تحقیق، تعداد ۶۱ نشانگر SSR و ۷۴ نشانگر AFLP، چندشکلی خوبی در بین والدین نشان دادند که برای تهیه نقشه پیوستگی جمعیت مورد استفاده قرار گرفتند. نقشه حاصل، ۴/۱۷۸۶ سانتی مورگان از ژنوم برنج را پوشش داد و فاصله متوسط هر دو نشانگر مجاور از یکدیگر ۰۶/۱۴ سانتی مورگان بود. با استفاده از روش مکان یابی فاصله ای مرکب، برای ارتفاع بوته، پنج QTL روی کروموزوم های ۳، ۷، ۹، ۱۰و ۱۱ و برای روز تا رسیدگی کامل نیز دو QTL بر روی کروموزوم های ۶ و ۷ شناسایی شدند. این QTLها در مجموع به ترتیب ۸/۶۲ درصد و ۹/۲۳ درصد از تنوع فنوتیپی این دو صفت را پوشش دادند. از میان QTLهای شناسایی شده، qPH-۳ (در فاصله بین نشانگرهای P۳۶-M۴۲-۳_RM۲۳۲) و qPH-۱۰ (در فاصله بین نشانگرهای RM۱۴۷_P۷۷-M۶۲-۴) برای ارتفاع بوته و qMD-۶ (در فاصله بین نشانگرهای RM۳۱۴_P۵۱-M۷۴-۴) برای روز تا رسیدگی کامل، به ترتیب با فاصله ۵/۵، ۷/۱۹ و ۸/۰ سانتی مورگان از نزدیک ترین نشانگر و ۱۶/۱۷، ۴۷/۱۵ و ۷۱/۱۵ درصد از تنوع فنوتیپی صفات مربوطه را کنترل کردند و به عنوانQTL های موثر و نسبتا بزرگ اثر ارتفاع بوته و زمان رسیدگی شناسایی شدند. نتایج این تحقیق نشان داد که می توان از سه QTL فوق برای هرمی کردن ژن ها یا از نشانگرهای پیوسته با آنها برای استفاده در برنامه های انتخاب به کمک نشانگر به منظور انتخاب لاین های پاکوتاه و زودرس در لاین های در حال تفرق برنج مورد مطالعه، استفاده نمود.

کلیدواژه ها

Linkage map, Microsatellite marker, QTL analysis and Rice., برنج, تجزیه QTL, نشانگر ریزماهواره و نقشه پیوستگی.

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.