Bioinformatics analysis of gene expression profiling for identification of key proteins associated with Hepatocellular Carcinoma
- سال انتشار: 1400
- محل انتشار: اولین همایش بین المللی و دهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران
- کد COI اختصاصی: IBIS10_248
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 285
نویسندگان
Higher Education Institute, meymeh. Iran
The National Research Center for Genetic Engineering and Biotechnology, Tehran, Iran
چکیده
Hepatocellular carcinoma is a type of primary liver cancer.HCC is the sixth most common cancer in the worldand the third leading cause of cancer deaths. The most important cause of death in patients with HCC is morethan ۸۰% of cronic hepatitis B or hepatitis C in fection and long _term use of aflatoxin. One of thecharacteristics of this malignancy is the high rate of progression of this disease HCC is a malignant tumorwith a poor diagnosis that surgery and liver transplantation have been the two main treatments that can bepreformed only in the early stages.Objective: The aim of this study was to identify key genes, biological pathways and new drug targets usingappropriate bioinformatics toola to combat hepatocellular carcinoma.Methods: in this study microarray expressive data downloaded from GEO database was used, which usedGEO۲R online server to analyze the data.protein interaction was also potted using a network analysis criteriawere preformed using cytoscape software using the centiscape plugin analysis of gene categories was alsoobtained using a metascape. finally, ۹ key genes were identified, including CCNA۲, CCNB۱, TYMS, EZH۲,PCNA, CDK۱, CAT, ESR۱, ALB.Also different key pathways have been identifided that are associated with hepatocellularcarcinoma.identification of these genes and key pathways involved in hcc discovering the disease mechanismand appropriate drug targets.کلیدواژه ها
Hepatocellular Carcinoma, Hepatitis B, Hepatitis C, microarray Techniqueمقالات مرتبط جدید
- تولید آنتی بادی پلی کلونال مونواسپسیفیک جهت شناسایی باکتریهای جنس سالمونلا
- بررسی فراوانی سویه های مدرن و اجدادی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بر اساس نشانگر TbD۱ در شمال غرب ایران
- The impact of the gut microbiome on metabolic, psychiatric, and immune diseases
- پیشگیری از سرطان خون سفری به سوی زندگی سالمتر
- Investigating the Effect of Pulegone and Neomenthol Compounds in Cancer Inhibition Using Molecular Docking
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.