آنالیز ترانسکریپتوم(Transcriptome analysis) مقاومت میزبانی و غیر میزبانی در جو نسبت به قارچهای عامل زنگ برگی
- سال انتشار: 1390
- محل انتشار: اولین کنگره ملی علوم و فناوریهای نوین کشاورزی
- کد COI اختصاصی: MAST01_907
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 2171
نویسندگان
مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی زنجان
مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی خراسان رضوی
IPK (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research),Gatersleben, Germany
Wageningen University, laboratory of plant breeding, Wageningen, The Netherlands
چکیده
به منظور مطالعه ژنهایی که به صورت افتراقی در مواجه با آلودگی با زنگهای میزبان و غیر میزبان بیان می شوند، مطالعه ای با استفاده از یک رقم جو به نام L94 و دو پاتوژن عامل زنگ برگی به نامP. hordei و P. recondita f. sp. recondita انجام گردید. رقم جو مذکور به ترتیب میزبان حساس و غیر میزبان به دو قارچ مذکور محسوب می شوند. گیاهچه های 12 روزه جو با استفاده از یوردوسپور های قارچهای فوق به صورت جداگانه و در سه تکرار مختلف تلقیح گردید.. حدود 18 ساعت بعد از تلقیح، برگهای تلقیح شده برداشت و بعد از غوطه ور شدن در ازت مایع، به فریزر 80- منتقل و تا استخراج RNAنگهداری گردید. برای مطالعه بیان ژنها از آرایه cDNA جو ( PGRC2 cDNA macroarray) تهیه شده درIPK در آلمان استفاده گردید که در آن حدود 10000 ژن منفرد در روی دو ممبران جداگانه لکه گذاری شده اند. پروب های رشته دوم cDNA لیبل شده با فسفر 33(33P-labelled second-strand cDNA probes) تهیه شدو آرایه cDNAابتداء هیبرید مقدماتی و سپس با پروب های cDNA به مدت 18 ساعت هیبرید نهایی شدند. برای شناسایی اسپات ها و نرمال کردن داده ها، ممبران های هیبرید شده به وسیله اسکنر مورد تجزیه وتحلیل قرار گرفت. تنها ژنهای منفردی که دارای نسبت سیگنال/زمینه بالاتر از 2 برابر در حد اقل دو تا از هیبرید ها بودند انتخاب شدند. در مجموع حدود 250 ژن از مجموع 10000 ژن لکه گذاری شده در این آزمایش بیان شدند. تعداد 14 ژن که به صورت افتراقی در تعامل سازگار و ناسازگار بیان شده بودند به عنوان ژنهای کاندید برای مطالعات بعدی انتخاب گردیدکلیدواژه ها
مقاومت غیر میزبانی، آنالیز نرانسکرپتوم، میکرو اری، جومقالات مرتبط جدید
- رویکرد اخیر صیادان در تنوع بخشی بهابزار صید گرگور به منظور استحصال آبزیان خلیج فارس (بندر بوشهر)
- نقش منابع طبیعی و محیط زیست در امنیت غذایی
- تهیه فرآورده های پروتئینی از آبزیان
- بررسی پیشرفت های اخیر در پژوهشهای بیوتکنولوژی مواد غذایی
- تغییرات شیمیایی رخ داده در طی فرآیند سرخ کردن در روغن زیاد بر اساس برخی محصولات واکنش
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.