Assessment of Genetic Diversity in Iranian Apple Genotypes Using SSR Markers

  • سال انتشار: 1401
  • محل انتشار: مجله بین المللی علوم و فنون باغبانی، دوره: 9، شماره: 4
  • کد COI اختصاصی: JR_IJHST-9-4_010
  • زبان مقاله: انگلیسی
  • تعداد مشاهده: 150
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

Seyed Abolfazl Hassani

Faculty of Plant Production, Gorgan University of Agriculture and Natural Resources

Ali Salehi Sardoei

Faculty of Plant Production, Gorgan University of Agriculture and Natural Resources

Hamideh Azad Ghouge Bigloo

Faculty of Agriculture, University of Zabol

Hadi Ghasemi

Faculty of Agriculture, University of Shahrood

Amir Ghorbanzadeh

Faculty of Plant Production, Gorgan University of Agriculture and Natural Resources

چکیده

Various markers can be used for accurate identifications of plant genotypes and cultivars. Since microsatellite markers of simple sequence repeats (SSRs) are abundant and reliably reproducible, ۱۴ pairs were used for evaluating polymorphic levels among ۳۳ apple genotypes. All ۱۴ pairs of primers had high degrees of polymorphism, ranging from three alleles (in the case of primers CH۰۱h۰۱ and CH۰۲d۱۲) to ۱۲ alleles in primer CH۰۵d۰۴. In total, ۸۳ polymorphic alleles appeared in these ۱۴ SSR loci (with an average of ۵.۹۲ alleles per gene locus), and the polymorphic information content averaged ۰.۷۱. Dendrograms for molecular data were drawn based on the UPGMA method, and genotypes were divided into six main groups. The genotypes of Shahrood ۲۰ and Shahrood ۲۱ (۹۵%) had the highest similarity with each other, while Shahrood ۳ and Palestinian Malayer (۱۴%) had the lowest. Principal component analysis confirmed the results of cluster analysis to determine relationships between the genotypes.

کلیدواژه ها

Genetic diversity, heterozygosity, Iranian native apple, PIC, microsatellite markers, Similarity coefficient

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.