بررسی برهم کنش مولکولی لیگاندهای سیتوکاینی موثر بر رسپوترهای لنفوسیت B با استفاده از داکینگ مولکولی

سال انتشار: 1400
محل انتشار: اولین کنگره ملی رویکردهای نوآورانه در سیستم بیولوژی، داروسازی وصنایع غذایی
کد COI اختصاصی: SBPFST01_031
زبان مقاله: فارسی
تعداد مشاهده: 246

نویسندگان

دانشجوی کارشناسی ارشد زیست ( سلولی و مولکولی)، موسسه آموزش عالی کاویان

استادیار گروه زیست شناسی موسسه آموزش عالی کاویان

چکیده

این تحقیق با هدف بررسی برهم کنش مولکولی لیگاندهای سیتوکاینی موثر بر رسپتورهای لنفوسیت B با استفاده از داکینگ مولکولی انجام شده است. به همین منظور اینترلوکین ۲ به عنوان سایتوکاین و باریسیتینیب به عنوان داروی موثر بر رسپتورهای لنفوسیت B انتخاب و اطلاعات لازم جهت انجام داکینگ ، از طریق سرورهای اطلاعاتی نظیر، PDB, ZINCdata base KEGG Drug ,Drug bank و .... جمع آوری شد. سپس داکینگ با استفاده از نرم افزار Molegro virtual Docker انجام گردید. جهت بررسی پایداری ساختار کمپلکس حاصله و نفوذ سلولی آن شبیه سازی دینامیک مولکولی با استفاده از بسته گرومکس ۱/۲۰۱۶ و فورس فیلد CHARMM۲۷ به مدت ۵۰ نانوثانیه ران شد. در طول شبیه سازی دینامیک مولکولی میانگین انحراف مربعات ریشهRMSD و میانگین نوسانات مربعات ریشه RMSF و شعاع ژیراسیونRG ، پیوندهای هیدروژنی و فاصله لیگاند و کمپلکس مورد ارزیابی قرار گرفت که نتایج حاصله نشان داد که RMSD کمپلکس و لیگاند در انتهای ۵۰ نانوثانیه دارای شیب خطی بود و باندهای هیدروژنی رو به افزایش می باشد، همچنین شعاع ژیراسیون در انتهای شبیه-سازی کمتر شد و RMSF و فاصله لیگاند به رزیدجوها نیز از ابتدای شبیه سازی کمتر شد که همگی نشان از پایداری و استحکام ساختار می دهد

کلیدواژه ها

لیگاند سیتوکاینی، رسپتورهای لنفوسیت، داکینگ مولکولی، شبیه سازی دینامیک مولکولی

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.