تنوع ژنتیکی جدایه های فیتوپلاسمای همراه با بیماری جاروک بادام دراستان های فارس ، کرمان و کردستان

  • سال انتشار: 1391
  • محل انتشار: فصلنامه بیماریهای گیاهی، دوره: 48، شماره: 3
  • کد COI اختصاصی: JR_IJPP-48-3_006
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 113
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

حامد پورعلی

نویسنده

محمد صالحی

مسئول مکاتبه

چکیده

بیماری جاروک بادام که فیتوپلاسمای همراه با آن Candidatus Phytoplasma phoenicium نام دارد در حال حاضر یکی از مخرب ترین بیماری های بادام در ایران و لبنان است. تنوع ژنتیکی در فیتوپلاسمای همراه با جاروک بادام در نمونه های تهیه شده در دو نقطه از باغ های اطراف نیریز (جدایه های نیریز۱ونیریز۲)، یک نقطه از مشکان نیریز(جدایه مشکان)، دو نقطه در اطراف کرمان (جدایه های کرمان۱وکرمان۲) ویک نقطه در شهرستان سنندج (جدایه سنندج) بررسی گردید. نهال های بادام تلخ مایه زنی شده با جدایه های عامل جاروک بادام در شرایط کنترل شده واکنش های متفاوتی را نشان دادند.RFLP محصول PCR مستقیم با جفت آغازگرP۱/P۷(تقریبا ۱۸۰۰ جفت باز از اپرون ار.ان.ای ریبوزومی) با آنزیم های, CfoI, HaeIII, HinfI, HpaII, RsaI, TaqI AluI نشان داد که جدایه مشکان از نظر نقوس حاصل از برش با انزیم CfoI و جدایه کرمان ۲ از نظر نقوش حاصل از برش با آنزیمHinfIبا بقیه متفاوت اند و بر این اساس جدایه های مورد مطالعه در ۳ گروه قرار می گیرند.جدایه مشکان در گروه یک، جدایه کرمان۲ در گروه دو و جدایه های کرمان ا، سنندج، نی ریز ۱ و نی ریز ۲ در گروه سه قرار گرفتند. مقایسه میزان تشابه نوکلئوتیدی در ناحیه  SRنیز تفاوت جدایه های عامل جاروک بادام را تایید کرد و نشان داد که جدایه مشکان با دیگر جدایه های مورد مطالعه تفاوت قابل ملاحظه ای دارد.بررسی تبارزایی براساس ترادف اپرون آر ان ای ریبوزومی، جدایه های عامل جاروک بادام را در گروه جاروک نخود کبوتر (۱۶S rIX, Pigeon pea witches' broom)قرار داد و نشان داد که این جدایه ها یکسان نیستند. تمامی بررسی های مولکولی تفاوت جدایه خفر با جدایه های مورد مطالعه در این تحقیق را تایید کرد. بررسی های RFLP، مقایسه میزان تشابه نوکلئوتیدی و تبارزایی نشان داد که تفاوت ژنتیکی جدایه های جاروک بادام مربوط به ۶۰۰ جفت باز از اپرون ار ان ای ریبوزومی شامل انتهای́ ۵ژن ۱۶S، ناحیهSR  و ابتدای́  ۳ژن ۲۳S است.  

کلیدواژه ها

جاروک بادام, فیتوپلاسما, تنوع ژنتیکی

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.