ارزیابی روابط فیلوژنتیکی گونه های Trichoderma به دست آمده از شالیزارهای استان مازندران بر اساس توالیهای ژن tef۱α
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: فصلنامه بیماریهای گیاهی، دوره: 50، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_IJPP-50-2_004
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 161
نویسندگان
نوسنده
چکیده
جنس Trichodermaاز مهمترین جنسهای قارچی در زمینه کنترل بیولوژیک بیماریهای گیاهی، افزایش رشد و القای مقاومت در گیاهان به شمار میرود. ارتباط فیلوژنتیکی ۸۱ جدایه متعلق به شش گونه از این جنس (شامل چند جدایه بیوکنترل امید بخش) که از مزارع برنج استان مازندران به دست آمدهاند، بر اساس توالی قطعهای از ژن αtef۱بررسی شد. توالیهای ژن مذکور در جدایههای مورد آزمایش به همراه توالیهای به دست آمده از بانک ژن همردیفسازی شدند و تجزیه و تحلیل دادهها با روشهای پیوست همسایه ها، پارسمونی بیشینه و تکامل کمینه انجام شد. نتایج نشان داد که جدایههای متعلق به T. harzianum (فراوانترین گونه شالیزار در این تحقیق) ۱۴ هاپلوتیپ مختلف را تشکیل دادند که در پنج گروه مجزا قرار گرفتند و بنابراین این گونهی مرکب، بیشترین تنوع ژنتیکی را به نمایش گذاشت. جدایههای T. virens (دومین گونه فراوان مزارع برنج مازندران در این بررسی) فقط در دو هاپلوتیپ گروهبندی شدند. گونههای T. atroviride و T. hamatum با سه و دو جدایه به ترتیب سه و دو هاپلوتیپ را تشکیل دادند. سویههای بیوکنترل متعلق به یک گونه دارای هاپلوتیپهای متفاوتی بودند و همراه با سویههای غیر آنتاگونیست در شاخههای جداگانهای قرار گرفتند. در نتیجه، هاپلوتیپ منحصر به فردی از αtef۱ که به خاصیت آنتاگونیسم مرتبط باشد، بر اساس تجزیه و تحلیل توالی αtef۱تشخیص داده نشد. ارتباطی بین هاپلوتیپ و مکان جغرافیایی وجود نداشت و از یک مزرعه، گونهها و هاپلوتیپ های مختلف جداسازی شدند.کلیدواژه ها
: تنوع زیستی, هاپلوتیپ, برنج, کنترل بیولوژیک, ایراناطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.