بررسی برهنمکنش ترکیب مورین در میوه ی خوراکی چایوت با آنزیم DNA جیراز باکتریایی

و DNA جیراز آنزیمی است که ابرمارپیچ مثبت را به منفی یا به حالت استراحت تبدیل می کند. Sechiumedule یا چایوت از خانواده کدوییان می باشد. این میوه ی خوراکی حاوی ترکیباتی همچون کورستین، میریستین، مورین و کومپفرل می باشد. مورین با فرمول شیمیایی C۱۵H۱۰O۷ می باشد. هدف از این مطالعه، بررسی بر همکنش ترکیب مورین موجود در میوه ی خوراکی چایوت بر فعالیت آنزیم دی ان ای جیراز به روش داکینگ مولکولی می باشد. در این مطالعه، برای بررسی نحوه ی اتصال ترکیبات به جایگاه فعال آنزیم، ترسیم ساختار شیمیایی ترکیبات، بهینه سازی انرژی، مطالعات داکینگ و تجزیه و تحلیل های نهایی به ترتیب از نرم افزارهای Hyperchem ،ChemDraw AutoDockTools و DS Visualizer استفاده شد. ترکیب مورد مطالعه با آمینواسیدهای Thr۱۶۵،Gly۷۷،Asp۷۳ ،Val۷۱ ،Val۴۳ برهم کنش هیدروژنی می دهد. این در حالی است که آمینواسیدهای Arg۱۳۶ ،Asp۷۳ ،Asn۴۶ در برهمکنش بین کوکریستال و آنزیم نقش دارد آمینو اسید Asp۷۳ در برهم کنش هر دو ترکیب مورین و کوکریستال مشاهده شد.

کلیدواژه ها:

میوه ی چایوت ، DNA جیراز ، مورین ، مولکولار داکینگ ، مهارکننده