ویژگیهای بیولوژیکی و مولکولی فیتوپلاسماهای همراه با جاروک GF-۶۷۷ در ایران

  • سال انتشار: 1394
  • محل انتشار: فصلنامه بیماریهای گیاهی، دوره: 51، شماره: 2
  • کد COI اختصاصی: JR_IJPP-51-2_004
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 141
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

فریبا حق شناس

نویسنده

محمد صالحی

مسئول مکاتبه

ساسان قاسمی

نویسنده

چکیده

پایه GF-۶۷۷ (هیبرید بین هلو و بادام) یکی از مناسبترین پایهها در تولید نهالهای بادام و هلو میباشد. طی بازدیدهای سالهای ۱۳۸۸ و ۱۳۸۹ از درختان GF-۶۷۷ در بیدزرد و استهبان (استان فارس) علائم جاروک در آن ها مشاهده گردید. عامل بیماری جاروک GF-۶۷۷ در بیدزرد و استهبان از طریق پیوند از GF-۶۷۷، به نهالهای بادام تلخ، هلو و GF-۶۷۷ و با استفاده از سس (Cuscuta campestris Yank.)، از نهالهای آلوده بادام تلخ به پروانش و بادنجان منتقل شد و در آنها علائم بیماریهای فیتوپلاسمایی تولید کرد . واکنش دی ان ای کل استخراج شده از درختان GF-۶۷۷ در بیدزرد و استهبان و گیاهان مایه زنی شده با پیوند و سس، در آزمون پی سی آر مستقیم با استفاده از جفت آغازگر P۱/P۷ و پی سی آر دو مرحلهای با استفاده از جفت آغازگرهای P۱/P۷ و R۱۶F۲n/R۱۶R۲ مثبت بود و باند مورد انتظار به ترتیب ۱۸۰۰ و ۱۲۰۰ جفت بازی تکثیر شد. محصول پی سی آر مستقیم جدایههای بیدزرد و استهبان همسانهسازی و تعیین ترادف شد و تحت رس شمارهای JX۴۴۵۱۴۱ و JX۴۴۵۱۴۲ در بانک جهانی ترادفها ثبت گردید. جستجو با برنامه بلاست نشان داد که فیتوپلاسماهای عامل جاروک GF-۶۷۷ در بیدزرد و استهبان، متعلق به گروه ار ان ای ریبوزومی جاروک نخود کبوتر (Pigeon pea witches’- broom, ۱۶SrIX) میباشند. مقایسه چند شکلی طولی قطعات برشی RFLP)) محصول پی سی آر مستقیم فیتوپلاسماهای جاروک GF-۶۷۷ نشان داد که جدایههای بیدزرد و استهبان، با یکدیگر و همچنین با فیتوپلاسمای عامل جاروک بادام نیریز یکسان میباشند. با استفاده از RFLP مجازی مشخص گردید که جدایههای جاروک GF-۶۷۷ و فیتوپلاسمای عامل جاروک بادام نیریز، متعلق به زیرگروه ۱۶SrIX-B میباشند و با فیتوپلاسمای عامل جاروک بادام خفر تفاوت دارند. جدایههای بیدزرد و استهبان و فیتوپلاسمای عامل جاروک بادام خفر از نظر علائم بیماری در بادام تلخ و پروانش نیز قابل تشخیص بودند. تعلق جدایههای جاروک GF-۶۷۷ از بیدزرد و استهبان به گروه ۱۶SrIX و نزدیکی آنها به زیرگروه ۱۶SrIX-B در آنالیزهای فیلوژنتیکی با استفاده از ترادفهای کامل ژن ۱۶S rRNA و ناحیه SR نیز به اثبات رسید.

کلیدواژه ها

جاروک نخود کبوتر, جاروک بادام, چند شکلی طولی قطعات برشی, آنالیز فیلوژنتیکی, پایه GF-۶۷۷

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.