شناسایی، جداسازی و بررسی بیان خانواده ژنی هوئین در جو (Hordeum vulgare)
- سال انتشار: 1400
- محل انتشار: مجله پژوهش های ژنتیک گیاهی، دوره: 8، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_PGRLU-8-2_007
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 241
نویسندگان
Department of Plant Genetics and Breeding, Khorramabad Branch, Islamic Azad University, Khorramabad, Iran
Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran
Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran
Department of Agriculture, Kangavar Branch, Islamic Azad University, Kangavar, Iran
چکیده
امروزه پپتیدهای ضدمیکروبی به عنوان نسل جدیدی از آنتی بیوتیک ها برای درمان بیماری های میکروبی در انسان، جانوران و محافظت از گیاهان در مقابل بیمارگر های مختلف، شناخته می شوند. هوئین ها گروهی از پپتید های ضدمیکروبی به شمار می روند که به دلیل تنوع بسیار بالا و بیان در اندام های مختلف گیاهی و همچنین نقش موثر در پاسخ به تنش های زیستی و غیرزیستی به عنوان یکی از مهم ترین گروه از پپتیدهای ضدمیکروبی شناخته می شوند. هدف مطالعه حاضر شناسایی و جداسازی ژن های هوئین در گیاه جو و بررسی خصوصیات و میزان بیان آن ها در بافت ها و شرایط محیطی مختلف بود. بدین منظور تمام توالی های پروتئینی مربوط به ژن های هوئین گیاهی از پایگاه NCBI دریافت شدند. پس از به دست آمدن توالی مورد توافق، این توالی با استفاده از ابزار tBLASTn در برابر ژنوم جو مورد هم ردیفی قرار گرفت. نتایج حاصل از هم ردیفی، سرهم بندی شده و توالی های حاصل بلاست برای تعیین چارچوب خوانش باز (ORF) کامل، دمین های عملکردی، سیگنال پپتید، محل تجمع سلولی، خصوصیات فیزیکوشیمیایی، فراوانی اسیدهای آمینه، فعالیت ضدمیکروبی و الگوی بیان مورد بررسی قرار گرفتند. در نهایت با استفاده از واکنش PCR توالی کدکننده کامل هوئین ها تکثیر و به صورت آزمایشگاهی تایید شد. در این پژوهش، سیزده ژن هوئین با ORFهایی با طول متوسط ۸۱۳ جفت باز در گیاه جو شناسایی، جداسازی و توالی یابی شدند. ژن های هوئین جداسازی شده از جو با سایر هوئین های گیاهی، از نظر توالی ژنی و پروتئینی و همچنین خصوصیات ساختاری و عملکردی مشابهت بالایی نشان دادند. نتایج نشان داد که هوئین های گیاه جو مانند سایر هوئین های گیاهی، بدون اینترون و یا دارای تنها یک اینترون هستند و وجود سیگنال پپتید ترشحی، تجمع خارج سلولی، وجود دمین های عملکردی ChtBD۱ در همه آن ها و دمین عملکردی Lyz-like در برخی از آ ن ها، تایید شد. همچنین نتایج نشان داد که فعالیت ضدمیکروبی و بیان حداکثری در ریشه و اندام های زایشی و همچنین بیان در پاسخ به تنش های زیستی و غیرزیستی از دیگر ویژگی های این پروتئین ها است. یافته های مطالعه حاضر درک ما را در مورد اثر ژن های هوئین در فرآیندهای زیستی گیاه مانند رشد و نمو و همچنین پاسخ به تنش های زیستی و غیرزیستی افزایش می دهد.کلیدواژه ها
Gene expression, Biotics and abiotics stresses, ChtBD۱ functional domains, Hevein, بیان ژن, تنش های زیستی و غیرزیستی, دمین عملکردی ChtBD۱, هوئیناطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.