ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

طراحی in silico و تایید in vitro برای siRNA هدف گیرنده ژن PTX۳ در رده سلولی گلیوما

محل انتشار: دوماهنامه فیض، دوره: 26، شماره: 1
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 198

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1429153

شناسه ملی سند علمی:

JR_FEYZ-26-1_002

تاریخ نمایه سازی: 28 فروردین 1401

چکیده مقاله:

سابقه و هدف: شناسایی مکانیسم های زمینه ای پاتوژنز گلیوما از اهمیت ویژه ای برخوردار است. بیان بیش از حد ژن PTX۳ عمیقا در پاتوژنز گلیوما نقش دارد. سرکوب بیان ژن هدف بر پایه تداخل RNA (RNAi) ازطریق مولکول های RNA دورشته ای ازجمله siRNA می تواند به عنوان یک ابزار درمانی برای خاموشی انکوژن استفاده شود. هدف مطالعه حاضر، القای آپوپتوز در رده سلولی گلیومای U-۸۷ با سرکوب ژن PTX۳ است. مواد و روش ها: انواع روش های in silico برای طراحی siRNA در برابر ژن PTX۳ استفاده شد، سپس امتیاز بندی طبق قوانین طراحی صورت گرفت. بهترین مولکول siRNA علیه ژن PTX۳ انتخاب و همچنین siRNA درهم ریخته آن نیز طراحی و کارایی خاموش کردن PTX۳ در سلول های U-۸۷ توسط Real-time PCR ارزیابی شد. همچنین میزان مرگ سلول های ترنسفکت شده با گروه های کنترل توسط فلوسایتومتری مقایسه شد تا اثر کاهش بیان PTX۳ بر آپوپتوز سلولی بررسی شود. نتایج: ۵۳ مولکول PTX۳-siRNA طراحی شده از جهات گوناگون، بررسی و امتیاز دهی و بهترین موارد جهت استفاده در تحقیقات سرکوب بیان ژن PTX۳ پیشنهاد شدند. تیمار ۷۲ ساعته سلول های U-۸۷ با PTX۳-siRNA طراحی شده در غلظت ۱۰۰ نانومولار قادر به کاهش بیان PTX۳ به میزان ۶۹ درصد بود. نتایج فلوسایتومتری نیز نشانگر القای آپوپتوز در ۶۵ درصد سلول ها بود. نتیجه گیری: کارآیی siRNA طراحی شده با روش in vitro تایید شد که بر کاهش بیان ژن PTX۳ و القای آپوپتوز در سلول های گلیوما U-۸۷ تاثیر قابل ملاحظه ای داشت.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

رضا احمدی بنی

Department of Medical Genetics, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, I.R. Iran.

شیرین شهبازی

Department of Medical Genetics, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, I.R. Iran.

علیرضا خوشنویسان

Department of Neurosurgery, Shariati Hospital, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, I.R. Iran.

جواد بهروزی

Research Center for Cancer Screening and Epidemiology, AJA University of Medical Sciences, Tehran, I.R. Iran.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Delgado-López PD, Corrales-García EM. Survival in glioblastoma: a review on ...
  • Pessina F, Navarria P, Cozzi L, Ascolese AM, Simonelli M, ...
  • Ahmadi-Beni R, Khoshnevisan A. An overview of crucial genes involved ...
  • Ahmadi-Beni R, Najafi A, Savar SM, Mohebbi N, Khoshnevisan A. ...
  • Noori-Daloii M-R, Ahmadi-beni R. Glioblastoma gene therapy and related delivery ...
  • Wang Z, Wang X, Zou H, Dai Z, Feng S, ...
  • Giacomini A, Ghedini GC, Presta M, Ronca R. Long pentraxin ...
  • Doni A, Stravalaci M, Inforzato A, Magrini E, Mantovani A, ...
  • Wang Z, Wang X, Zhang N, Zhang H, Dai Z, ...
  • Petterson SA, Sørensen MD, Kristensen BW. Expression profiling of primary ...
  • Locatelli M, Ferrero S, Boneschi FM, Boiocchi L, Zavanone M, ...
  • Yeh CM, Lin CW, Chuang CY, Liu YF, Chou CH, ...
  • Gluszek S, Matykiewicz J, Grabowska U, Chrapek M, Nawacki L, ...
  • Goulart MR, Watt J, Siddiqui I, Lawlor RT, Imrali A, ...
  • Choi B, Lee E-J, Shin M-K, Park YS, Ryu M-H, ...
  • Choi B, Lee EJ, Park YS, Kim S-M, Kim EY, ...
  • Hu T, Qiao L, Li H, Ren H, Ning Q, ...
  • Ahmmed B, Kampo S, Khan M, Faqeer A, Kumar SP, ...
  • Ying TH, Lee CH, Chiou HL, Yang SF, Lin CL, ...
  • Yu LM, Wang WW, Qi R, Leng TG, Zhang XL. ...
  • Kampo S, Ahmmed B, Zhou T, Owusu L, Anabah TW, ...
  • Zhang P, Liu Y, Lian C, Cao X, Wang Y, ...
  • Wills CA, Liu X, Chen L, Zhao Y, Dower CM, ...
  • Chang X, Li D, Liu C, Zhang Z, Wang T. ...
  • Stallone G, Netti GS, Cormio L, Castellano G, Infante B, ...
  • Güzel Ö, Kösem A, Aslan Y, Asfuroglu A, Balci M, ...
  • Falagario UG, Busetto GM, Netti GS, Sanguedolce F, Selvaggio O, ...
  • Netti GS, Lucarelli G, Spadaccino F, Castellano G, Gigante M, ...
  • Liu B, Zhao Y, Guo L. Increased serum pentraxin-۳ level ...
  • Deng H, Fan X, Wang X, Zeng L, Zhang K, ...
  • Cabiati M, Gaggini M, De Simone P, Del Ry S. ...
  • Carmo RF, Aroucha D, Vasconcelos LRS, Pereira L, Moura P, ...
  • Rathore M, Girard C, Ohanna M, Tichet M, Jouira RB, ...
  • Guo P, Zhang SZ, He H, Zhu Y-T, Tseng SCG. ...
  • Lee HH, Kim SY, Na JC, Yoon YE, Han WK. ...
  • Lian C, Huang Q, Zhong X, He Z, Liu B, ...
  • He D, Yan L. MiR-۲۹b-۳p aggravates cardiac hypoxia/reoxygenation injury via ...
  • Chang WC, Wu SL, Huang WC, Hsu JY, Chan SH, ...
  • Ahmmed B, Khan MN, Nisar MA, Kampo S, Zheng Q, ...
  • Chan SH, Tsai JP, Shen CJ, Liao YH, Chen BK. ...
  • Thomas C, Henry W, Cuiffo BG, Collmann AY, Marangoni E, ...
  • O’Keefe EP. siRNAs and shRNAs: Tools for protein knockdown by ...
  • Jinek M, Doudna JA. A three-dimensional view of the molecular ...
  • Paddison PJ, Caudy AA, Bernstein E, Hannon GJ, Conklin DS. ...
  • Malekshahi SS, Arefian E, Salimi V, Azad TM, Yavarian J. ...
  • Tuschl T. Tom Tuschl's motif siRNA design rules and siRNA ...
  • Available at: http://www.protocol-online.org/prot/Protocols/Rules-of-siRNA-design-for-RNA-interferenceRNAi۳۲۱۰.htmlBaghban-Kohnehrouz B, Nayeri S. Design, simplified cloning, and ...
  • McIntyre GJ, Yu YH, Lomas M, Fanning GC. The effects ...
  • Bofill-De Ros X, Gu S. Guidelines for the optimal design ...
  • Fakhr E, Zare F, Teimoori-Toolabi L. Precise and efficient siRNA ...
  • Tung JN, Ko CP, Yang SF, Cheng CW, Chen P-N, ...
  • Liu Q, Wang XY, Qin YY, Yan XL, Chen HM, ...
  • Ke HH, Hueng DY, Tsai WC. Low expression of pentraxin ...
  • Li Y, Song X, Niu J, Ren M, Tang G, ...
  • Delgado-López PD, Corrales-García EM. Survival in glioblastoma: a review on ...
  • Pessina F, Navarria P, Cozzi L, Ascolese AM, Simonelli M, ...
  • Ahmadi-Beni R, Khoshnevisan A. An overview of crucial genes involved ...
  • Ahmadi-Beni R, Najafi A, Savar SM, Mohebbi N, Khoshnevisan A. ...
  • Noori-Daloii M-R, Ahmadi-beni R. Glioblastoma gene therapy and related delivery ...
  • Wang Z, Wang X, Zou H, Dai Z, Feng S, ...
  • Giacomini A, Ghedini GC, Presta M, Ronca R. Long pentraxin ...
  • Doni A, Stravalaci M, Inforzato A, Magrini E, Mantovani A, ...
  • Wang Z, Wang X, Zhang N, Zhang H, Dai Z, ...
  • Petterson SA, Sørensen MD, Kristensen BW. Expression profiling of primary ...
  • Locatelli M, Ferrero S, Boneschi FM, Boiocchi L, Zavanone M, ...
  • Yeh CM, Lin CW, Chuang CY, Liu YF, Chou CH, ...
  • Gluszek S, Matykiewicz J, Grabowska U, Chrapek M, Nawacki L, ...
  • Goulart MR, Watt J, Siddiqui I, Lawlor RT, Imrali A, ...
  • Choi B, Lee E-J, Shin M-K, Park YS, Ryu M-H, ...
  • Choi B, Lee EJ, Park YS, Kim S-M, Kim EY, ...
  • Hu T, Qiao L, Li H, Ren H, Ning Q, ...
  • Ahmmed B, Kampo S, Khan M, Faqeer A, Kumar SP, ...
  • Ying TH, Lee CH, Chiou HL, Yang SF, Lin CL, ...
  • Yu LM, Wang WW, Qi R, Leng TG, Zhang XL. ...
  • Kampo S, Ahmmed B, Zhou T, Owusu L, Anabah TW, ...
  • Zhang P, Liu Y, Lian C, Cao X, Wang Y, ...
  • Wills CA, Liu X, Chen L, Zhao Y, Dower CM, ...
  • Chang X, Li D, Liu C, Zhang Z, Wang T. ...
  • Stallone G, Netti GS, Cormio L, Castellano G, Infante B, ...
  • Güzel Ö, Kösem A, Aslan Y, Asfuroglu A, Balci M, ...
  • Falagario UG, Busetto GM, Netti GS, Sanguedolce F, Selvaggio O, ...
  • Netti GS, Lucarelli G, Spadaccino F, Castellano G, Gigante M, ...
  • Liu B, Zhao Y, Guo L. Increased serum pentraxin-۳ level ...
  • Deng H, Fan X, Wang X, Zeng L, Zhang K, ...
  • Cabiati M, Gaggini M, De Simone P, Del Ry S. ...
  • Carmo RF, Aroucha D, Vasconcelos LRS, Pereira L, Moura P, ...
  • Rathore M, Girard C, Ohanna M, Tichet M, Jouira RB, ...
  • Guo P, Zhang SZ, He H, Zhu Y-T, Tseng SCG. ...
  • Lee HH, Kim SY, Na JC, Yoon YE, Han WK. ...
  • Lian C, Huang Q, Zhong X, He Z, Liu B, ...
  • He D, Yan L. MiR-۲۹b-۳p aggravates cardiac hypoxia/reoxygenation injury via ...
  • Chang WC, Wu SL, Huang WC, Hsu JY, Chan SH, ...
  • Ahmmed B, Khan MN, Nisar MA, Kampo S, Zheng Q, ...
  • Chan SH, Tsai JP, Shen CJ, Liao YH, Chen BK. ...
  • Thomas C, Henry W, Cuiffo BG, Collmann AY, Marangoni E, ...
  • O’Keefe EP. siRNAs and shRNAs: Tools for protein knockdown by ...
  • Jinek M, Doudna JA. A three-dimensional view of the molecular ...
  • Paddison PJ, Caudy AA, Bernstein E, Hannon GJ, Conklin DS. ...
  • Malekshahi SS, Arefian E, Salimi V, Azad TM, Yavarian J. ...
  • Tuschl T. Tom Tuschl's motif siRNA design rules and siRNA ...
  • Available at: http://www.protocol-online.org/prot/Protocols/Rules-of-siRNA-design-for-RNA-interferenceRNAi۳۲۱۰.htmlBaghban-Kohnehrouz B, Nayeri S. Design, simplified cloning, and ...
  • McIntyre GJ, Yu YH, Lomas M, Fanning GC. The effects ...
  • Bofill-De Ros X, Gu S. Guidelines for the optimal design ...
  • Fakhr E, Zare F, Teimoori-Toolabi L. Precise and efficient siRNA ...
  • Tung JN, Ko CP, Yang SF, Cheng CW, Chen P-N, ...
  • Liu Q, Wang XY, Qin YY, Yan XL, Chen HM, ...
  • Ke HH, Hueng DY, Tsai WC. Low expression of pentraxin ...
  • Li Y, Song X, Niu J, Ren M, Tang G, ...
    • نمایش کامل مراجع