تعیین ساختار ژنتیکی به کمک توالی یابی در گیاهان زینتی
- سال انتشار: 1400
- محل انتشار: دوفصلنامه گل و گیاهان زینتی، دوره: 6، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_FLOWER-6-2_002
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 257
نویسندگان
ferdowsi University of Mashhad
Ferdowsi University of Mashhad
چکیده
بهنژادی مولکولی برای بسیاری از گیاهان زینتی با چالش های زیادی ازجمله اندازه بزرگ ژنوم، چندگانی و یا نبود منابع ژنتیکی کافی روبهرو است. توالی یابی نسل بعدی (NGS)، روشی موثر برای گسترش تعداد زیادی از نشانگرهای DNA در یک بازه زمانی کوتاه است. در حال حاضر، چندشکلی های تک نوکلئوتیدی (SNP) به عنوان یکی از محبوب ترین نشانگرهای DNA، شناخته می شوند و در بسیاری از بررسی ها مورد استفاده قرار می گیرند. یکی از روش هایی که امروزه به کمک نشانگر SNP برای ارزیابی ژرم پلاسم گیاهی با ژنوم های پیچیده و توالی یابی نشده نوآوری شده است، روش تعیین ساختار ژنتیکی به کمک توالی یابی (GBS) می باشد. تا کنون، از این روش برای بهنژادی و ارزیابی ژنتیکی ژرم پلاسم برخی از گونه های گیاهان زینتی از جمله رز، ارکیده و اطلسی استفاده شده است. از میان این بررسی ها، یک پژوهش روی ادریسی با هدف بررسی پویش کل ژنومی (GWAS)، ده پژوهش برای بررسی گوناگونی ژنتیکی گونه های زینتی مختلف از جمله Gloxinia، ارکیدهDendrobium و همچنین درختان زینتی Marshall Franklinia alatamaha وCornus florida L.، چهار بررسی برای ساخت و تکمیل نقشه ژنتیکی گیاهانی از جمله رز و اطلسی و سه بررسی برای گسترش نشانگرهای مولکولی در گونه های رز، یاس بنفش و ادریسی و یک پژوهش برای بررسی گوناگونی ژنتیکی درون و بین گونه ای سریش های ایران انجام شده است. از این روش می توان برای شناسایی گوناگونی ژنتیکی برای ساخت نقشه های ژنتیکی لینکاژی با تراکم بالا و کشف نشانگرهای مولکولی لازم در بررسی های QTL، GWAS و همچنین برای شناسایی ژنهای نامزد ازجمله ژن های کنترل کننده فرآیند گلدهی بهره برد. روش تعیین ساختار ژنتیکی به کمک توالی یابی با توجه به هزینه کم به ازای هر نشانگر در مقایسه با سایر روش های تعیین نژادگان موجود در دنیا و همچنین کارایی و دقت بالا، می تواند به شکل گسترده ای در بررسی های ژنتیکی، توالی یابی و بهنژادی گیاهان زینتی مورد استفاده قرار گیرد.کلیدواژه ها
Next generation sequencing, Genotyping-by-sequencing, Ornamental plants, Molecular markers, توالی یابی نسل بعد, تعیین ساختار ژنتیکی به کمک توالی یابی, گیاهان زینتی, نشانگرهای مولکولیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.