پیش بینی خانواده آنزیم ها با استفاده از روشهای بیزین و KNN

سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,373

فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NCCIT01_026

تاریخ نمایه سازی: 17 اردیبهشت 1391

چکیده مقاله:

تقریبا تمام آنزیم ها پروتئین هستند آنها کاتالیزورهای بیولوژیکی هستندکه باعث سرعتبخشیدن به عملکرد واکنشهای سلولی می شوند به خاطر خصوصیاتمختلف وظایف واکنشها آنها را به شش دسته تقسیم می کنند اوکسیدوریدوکتاز، ترانسفیراز، هیدرولاز، لیاز، ایزومیراز، لیگاز پیش بینی کلاس آنزیم ها از اهمیت ویژه ای در شناسایی اینکه آنزیم جز کدام پروتئین است را دارا است از آنجایی که توالی انزیم ها برخلاف تجزیه و تحلیل تجربی در پیش بینی کلاسهای آنزیمها برای یافتن توالی آنزیمهای جدید روز به روز افزایش می یابد استفاده از روشهای داده کاوی بسیار مفید است درحالیکه دسته بندKNN که یکی از روشهای داده کاوی است زمان طولانی را برای پیش بینی آنزیم ها مصرف می کند که این به صرفه نیست بنابراین برای صرف زمان کمتر در پیش بینی انزیم ها دراین مقاله دو روش دسته بند بیزین پیشنهاد شده است که این روشها به منظور دسته بندی آنزیمها براساس ترکیب آمینه اسیدشان اجرا شده اند و معیارهای کارایی و میزان زمان مصرفی برای اجرای الگوریتم ها نیز مقایسه شده اند که روشهای بیزین زمان اجرای کمتری را نسبت به روش KNN می گیرند.

نویسندگان

الهه سیاری

دانشجوی کارشناسی ارشد دانشگاه آزاد اسلامی واحد مشهد

مهرداد جلالی

عضو هیئت علمی دانشگاه آزاد اسلامی واحد مشهد

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Chou, K.C., 2005. Using amphiphilic pseudo amino acid composition to ...
  • Bahar, I., Atilgan, A.R., Jernigan, R.L, Erman, B., 1997. Understanding ...
  • uang, W.L, Chena, H.M., Hwang, S.F., Ho, S.Y., 2007. Accurate ...
  • Bairoch, A., 2000. The ENZYME database in 2000. Nucleic Acids ...
  • Nasibov, E., Kandemir- Cavas , C., 2008. Protein subcellular location ...
  • Borro, L.C., Oliveira, S.R.M., Yamagishi, M.E.B., Mancini, A.L., Jardine, J.G., ...
  • Zafer Barutcuoglu Christopher DeCoro, 2008. Hierarchical Shape Classi_cation Using Bayesian ...
  • نمایش کامل مراجع