جداسازی و آنالیز فیلوژنتیکی یک جدایه ویروس پیچیدگی برگ شلغم از گیاه تاتوره
- سال انتشار: 1397
- محل انتشار: فصلنامه بیماریهای گیاهی، دوره: 54، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_IJPP-54-2_003
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 223
نویسندگان
دانش آموخته دکتری بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
استاد بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
استاد بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
چکیده
ویروس پیچیدگی برگ شلغم (Turnip curly top virus,TCTV) به عنوان ویروس تیپ جنس Turncurtovirus از خانواده Geminiviridae چند سال قبل از ایران گزارش گردید. این ویروس دارای دامنه میزبانی وسیعی در میان سبزیجات و علف های هرز است. در این پژوهش، آلودگی گیاه تاتوره (Datura stramonium L.) با علائم زردی عمومی، پیچیدگی شدید و فنجانی شدن برگ ها با استفاده از آزمون پی سی آر، به TCTV اثبات گردید. سپس طول کامل ژنوم ویروس با تلفیق پی سی آر و روش تکثیر دایره غلتان (rolling circle amplification, RCA) و استفاده از یک جفت آغازگر همپوشان تکثیر و بعد از همسانه سازی، در ناقل pJET۱.۲ تعیین ترادف گردید و ترادف بدست آمده به لحاظ فیلوژنتیکی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج بدست آمده بیانگر آن است که جدایه تاتوره دارای بیشترین و کمترین میزان شباهت (بترتیب ۲/۹۹ و ۸/۸۵ درصد) با جدایه های همین ویروس می باشد که پیشتر بترتیب از گیاهان شلغم و ترب گزارش شده اند. به رغم مشابهت بالای ترادف نوکلئوتیدی ژنوم جدایه تاتوره با جدایه شلغم، پروتئین rep رمزشده توسط جدایه تاتوره در انتهای N-terminal دارای ۱۴ اسیدآمینه بیشتر است. در میان نژادهای پنج گانه TCTV، جدایه تاتوره متعلق به نژاد C بوده و در کنار جدایه هائی قرار می گیرند که قبلا از گیاه شلغم یا از بدن زنجرک ها گزارش شده است. نتایج این تحقیق، بار دیگر دامنه میزبانی وسیع ترنکرتوویروس ها در علف های هرز و نقش آنها را در آلودگی سبزیجات تائید می کند.کلیدواژه ها
جمینی ویروس, ترنکرتوویروس, ویروس پیچیدگی برگ شلغم, تاتوره, تکثیر به روش دایره غلتاناطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.