آنالیز فیلوژنیک و مطالعه ی خصوصیات توالی ژن LSD۱۴۲ شش جدایه ی ویروس بیماری لمپی اسکین ایران و سویه های ثبت شده کاپری پاکس ویروس در بانک ژن

بیماری لمپی اسکین (lumpy skin disease: LSD) یک بیماری ویروسی در گاو است که زیان های اقتصادی قابل توجهی به صنعت دامپروری وارد می کند. هدف پژوهش کنونی، بررسی خصوصیات توالی ژن LSD۱۴۲ ، یکی از ژن های احتمالی موثر بر حدت، در ویروس LSD و آنالیز فیلوژنیک آن در شش جدایه ی ایران طی سال های ۱۳۹۴-۱۳۹۳ و سویه های کاپری-پاکس ویروس بانک ژن بود. در این پژوهش، ژن LSD۱۴۲ شش ویروس جدا شده از از استان های کرمانشاه، آذربایجان غربی، فارس، قم، خوزستان و خراسان شمالی توالی یابی شد. سپس با انجام آنالیز فیلوژنیک، قرابت آن ها با سایر ویرس های جنس کاپری پاکس ویروس موجود در بانک ژن مقایسه گردید. نتایج نشان دهنده همولوژی صددرصدی  شش جدایه مورد مطالعه با یک دیگر و همچنین با دیگر سویه های حاد عامل LSD در دنیا بود. همچنین، نتایج آنالیز فیلوژنیک نشان داد که با استفاده از اطلاعات توالی این ژن نه تنها می توان هر سه ویروس آبله ی بزی، آبله ی گوسفندی و ویروس LSD را از یک دیگر تفکیک نمود، بلکه ویروس حاد و واکسینال LSD نیز از یک دیگر قابل تمییز می باشند. خوشه ویروس های آبله ی بزی به سه دسته ی مختلف از نظر جغرافیایی تقسیم شد که سویه های آسیای جنوب غربی و آفریقایی، سویه های شرق آسیا و سویه های شمال غربی آسیا را در بر گرفت. در خوشه ویروس های آبله ی گوسفندی، تنها ویروس آفریقایی در خوشه مجزایی نسبت به دیگر سویه های آبله گوسفندی قرار گرفت. این یافته ها نشان می دهد که ژن LSD۱۴۲ می تواند در پایش برنامه های ریشه کنی و پژوهش های اپیدمیولوژیک کاپری پاکس ویروس ها مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه ها:

آنالیز فیلوژنیک ، توالی نوکلئوتیدی ، حدت ، کاپری پاکس ویروس