جداسازی و همسانه سازی (cloning) cDNA ژن منگنز پراکسیداز (mnp) از قارچ خوراکی دکمه ای سفید (Agaricus bisporus)، مقدمه ای بر دست ورزی ژنتیکی

سال انتشار: 1389
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 135

فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJPB-2-3_003

تاریخ نمایه سازی: 26 دی 1400

چکیده مقاله:

   تولید و پرورش قارچ خوراکی، یکی از کاربردهای تجاری فناوری های میکروبی به منظور تبدیل زیستی ضایعات بخش کشاورزی به فرآورده های با ارزش غذایی است. در قارچ­ خوراکی دکمه ای ( Agaricus bisporus ) آنزیم های مختلفی از ابتدای رشد میسلیومی تا انتهای دوره میوه­دهی، تجزیه ترکیبات لیگنینی را در محیط کمپوست برعهده دارند. یکی از مهمترین این آنزیم ها، آنزیم منگنز پراکسیداز است که سهم عمده­ای در تجزیه ترکیبات لیگنینی دارد. به منظور انجام مطالعات ملکولی بر روی آنزیم منگنز پراکسیداز در قارچ خوراکی دکمه­ای سفید نژاد IM۰۰۸ و آماده نمودن زمینه برای افزایش تولید این آنزیم در قارچ خوراکی دکمه­ای، اقدام به جداسازی و همسانه سازی cDNA ژن کدکننده آنزیم منگنز پراکسیداز گردید. برای این منظور استخراج RNA از میسلیوم­های رشد یافته قارچ خوراکی بر روی محیط کشت مایع عصاره کمپوست انجام شد و cDNA آن به وسیله آنزیم رونوشت بردار معکوس ساخته شد. پس از تکثیر قطعه مورد نظر به وسیله واکنش زنجیره ای پلیمراز، قطعه تکثیرشده در ناقل pTZ۵۷R/T قرار گرفت و سپس به باکتری E.coli سویه DH۵α منتقل گشت. پس از استخراج پلاسمید از باکتری های تراریخته، پلاسمید استخراج شده مورد هضم آنزیمی قرار گرفت و در مرحله آخر قطعه تکثیرشده تعیین توالی شد. در نتایج، بلاست توالی نوکلئوتیدی در مکان­های بازهای نوکلئوتیدی با شماره های ۶۵۷ و ۸۵۰ با توالی ژن mnp موجود در بانک اطلاعاتی NCBI تفاوت داشت که به ترتیب، سبب تغییر اسید آمینه­ ایزولوسین به والین و اسید آمینه سرین به آلانین در توالی اسیدآمینه قطعه cDNA همسانه شده، می­شود.

کلیدواژه ها:

آنزیم رونوشت بردار معکوس ، ضایعات کشاورزی ، ناقل pTZ۵۷R/T ، همسانه سازی

نویسندگان

جواد حسن جانپور

گروه بیوتکنولوژی و به نژادی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران

محمد فارسی

گروه بیوتکنولوژی و به نژادی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • فارسی، م. و گردان، ح. ر. (۱۳۸۶) پرورش و اصلاح ...
  • قربانی­فعال، پ.، فارسی، م.، پوریان­فر، ح. ر.، محمودنیا میمند، م. ...
  • Chen, D. M., Taylor, A. F. S., Burke, R. M., ...
  • Chomszynski, P. and Sacchi, N. (۱۹۸۷) Single-step method of RNA ...
  • Heinzkill, M., Bech, L., Halkier, T., Schneider, P., and Anke, ...
  • Hofrichter, M. (۲۰۰۲) Review: lignin conversion by manganese peroxidase (MnP). ...
  • Irie, T., Honda, Y., Watanabe, T. and Kuwahara, M. (۲۰۰۱) ...
  • Kamitsuji, H., Honda, Y. Watanabe, T. and Kuwahara, M. (۲۰۰۴) ...
  • Lankinen, P., Hilden, K., Aro, N., Salkinoja-salonen, M. and Hatakka, ...
  • Lankinen, V. P., Bonnen, A. M., Anton, L. H., Wood, ...
  • Ma, B., Mayfield, M. B., Godfrey, B. J. and Gold, ...
  • Maniatis, T., Fritsch, E. F. and Sambrook, J. (۱۹۸۹) Molecular ...
  • Moloy, S. (۲۰۰۴) Sugar transport and water relations of Agaricus ...
  • Nagai, M., Sakamoto, Y. and Nakade, K. (۲۰۰۷) Isolation and ...
  • Sreenivasaprasad, S. (۲۰۰۰) Isolation of fungal nucleic acids. In: The ...
  • Tagger, S., Perissol, C., Gil, G., Vogt, G., and Le ...
  • نمایش کامل مراجع