شناسایی و توصیف تبارزائی تعدادی از جدایه های ایرنی ویروس موزائیک یونجه مبتنی بر ترادف ژن پروتئین حرکتی
- سال انتشار: 1400
- محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 13، شماره: 4
- کد COI اختصاصی: JR_JOAGK-13-4_005
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 386
نویسندگان
بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
کرمان، دانشگاه شهید باهنر، دانشکده کشاورزی، بخش گیاهپزشکی
بخش گیاهپزشکی،دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
چکیده
هدف: ویروس موزائیک یونجه (AMV) یکی از مهم ترین ویروس های گیاهی در ایران و جهان می باشد. هدف از این تحقیق، مطالعه تعدادی از جدایه های ایرانی این ویروس بر اساس ترادف ژن MP، بررسی موقعیت تبارزائی آن ها و مقایسه آن با ژن CP می باشد. مواد و روش ها: طی سال های ۱۳۹۳ تا ۱۳۹۶، از مزارع یونجه شش استان کشور (کرمان، هرمزگان، اصفهان، فارس، خوزستان و گلستان) بازدید گردید و از بوته های مشکوک (یونجه و علف هرز) نمونه گیری شد. جهت بررسی آلودگی نمونه ها، از آزمون الایزا و همچنین RT-PCR استفاده گردید. از بین جدایه های بررسی شده، ۲۰ جدایه شامل ۱۷ جدایه از گیاه یونجه و سه جدایه از علف های هرز نام های شیرتیغی ( L..Sonchus oleraceus)، سلمه تره ( L..Chenopodium amaranticolor) و بارهنگ (Plantago ovate L.)، جهت مطالعه مولکولی انتخاب و به دنبال آن موقعیت تاکسونومیکی جدایه های این ویروس بر اساس ژنوم کامل پروتئین حرکتی و همچنین ناحیه ای از آن مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج: رسم درخت تبارزایی بر اساس طول کامل ژن پروتئین حرکتی ویروس نشان داد که جدایه ها در دو گروه I و II قرار می گیرند که هر گروه نیز به دو زیر گروهA وB تقسیم می شوند. اکثر جدایه های ایرانی به تنهایی در گروه II واقع گردیده و تمامی جدایه های انتخاب شده از بانک ژن به همراه دو جدایه از ایران با رس شماره های KX۵۳۵۴۵۶ و KX۵۳۵۴۵۴در زیر گروه IA قرار گرفتند. اما زیر گروه IB نیز منحصر به سه جدایه ایرانی (رس شماره های KX۵۳۵۴۶۲، KX۵۳۵۴۵۸ و KX۵۳۵۴۶۰) است. در حالیکه براساس درخت تبارزایی بخشی از ژن یاد شده (۴۶۸ نوکلئوتید) اکثر جدایه های ایرانی به همراه یک جدایه از اسپانیا (JQ۶۹۱۱۶۳) زیر گروه جدیدی را تشکیل دادند. نتیجه گیری: یافته های حاصل از این تحقیق نشان داد ترادف ژن پروتئین حرکتی برای تعیین روابط تبارزائی جدایه های AMV موفق عمل نمود. از آنجائیکه گیاه یونجه بومی خاور نزدیک و آسیای مرکزی است احتمالا این ویروس از تنوع ژنتیکی نسبتا بالائی در ایران برخوردار می باشد.کلیدواژه ها
ویروس موزائیک یونجه, الایزای غیرمستقیم, پروتئین حرکتیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.