تعیین ساختار پروتئین و ارزیابی سطح بیان ژن Tup۱ قارچ Zymoseptoria tritici
- سال انتشار: 1400
- محل انتشار: فصلنامه زیست شناسی میکروارگانیسمها، دوره: 10، شماره: 40
- کد COI اختصاصی: JR_BJM-10-40_004
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 276
نویسندگان
دانش آموخته دکتری بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران ، ایران
استادیار گروه زیست فراورده های گیاهی، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری ، تهران، ایران
استاد بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
دانشیار بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
چکیده
مقدمه: قارچ Zymoseptoria tritici بیمارگر دیمورفی است که تغییر در الگوی رشد آن نقشی اساسی در ایجاد بیماری دارد. به همین جهت، پروتئینTup۱،که یک سرکوبگر رونویسی عمومی و تنظیم کننده شناخته شده ای برای تغییر شکل است، کاندیدای واجد شرایط برای مطالعه مقدماتی در این بیمارگر است.مواد و روشها: با استفاده از Saccharomyces cerevisiae Tup۱p بعنوان مدل، دومینهای عملکردی پروتئین با استفاده از نرم افزار InterPro (Pfam) ترسیم شد. سپس ساختار سوم Zt.Tup۱p توسط نرم افزار InterPro (Pfam)نشان داده شد. سرانجام ، میزان بیان Zt.Tup در شرایط in vitro و in vivo توسط Real-Time RT-PCR ارزیابی شد.نتایج: پروتئین Zt.Tup۱p دارای ساختارهای عمومی موجود در در سایر پروتئین های یوکاریوتی شبهTup ، شامل دومین N-ترمینال، منطقه میانی محافظت نشده و یک دومین C- ترمینال با هفت تکرار WD است. همچنین نتایج نشان داد که دو المنت غنی از گلوتامین (Q۱, Q۲) موجود در S. cerevisiae، در ساختار Zt.Tup۱p وجود ندارد. نتایج مشخص کردند که بیان ژن Zt.tup۱ در مرحله میسلیومی افزایش مییابد. بعلاوه افزایش بیان ژن در روزهای ۱۴ و ۲۴ بعد از تلقیح به گیاه نیز مشاهده شد.بحث و نتیجهگیری: وجود هفت تکرار WD محافظت شده در Zt.Tup۱p و سایر قارچ های مرتبط نشان میدهد که این دومینهای عملکردی نقش مهمی در زندگی این میکروارگانیسمها دارند. با توجه به دادههای مطالعه حاضر، بیان بالای ژن Zt.tup۱ در مرحله میسلیوم نشان میدهد که این پروتئین ممکن است نقش مهمی در توسعه میسلیوم و تشکیل کونیدی داشته باشد.علاوه بر این، افزایش بیان در زمان نکروتروفی که با توسعه پیکنیدی مشخص می شود، نشانگر این است که ژن ممکن است نقشی اساسی در رشد و بیماریزایی Z. tritici داشته باشد. مطالعه حاضر را میتوان بعنوان شروع یک نظریه پردازی جدید و جامع برای شفاف سازی عملکردهای دقیق این ژن در طول رشد و بیماری زایی در نظر گرفت.کلیدواژه ها
بیان ژن, بیماری زایی, تکرارهای WD, Tup۱, Zymoseptoria triticiاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.