Analysis of genetic diversity between and within Iranian accessions of spinach (Spinacia oleraceae) by SRAP markers

  • سال انتشار: 1392
  • محل انتشار: فصلنامه ژنتیک و اصلاح نژاد ایران، دوره: 2، شماره: 2
  • کد COI اختصاصی: JR_IJGPB-2-2_003
  • زبان مقاله: انگلیسی
  • تعداد مشاهده: 147
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

سمیه فهیم

.

عبدالعلی شجاعیان

.

علی اشرف محرابی

.

خدیجه قنبری

.

چکیده

Spinach (Spinacia oleracea L.) is an economically important leafy vegetable crop in many countries. This is the first case study of using SRAP markers to analyze genetic diversity of Iranian spinach accessions. Eight SRAP primer combinations generated ۸۸ scorable bands ranging from ۵۰ to ۱۰۰۰ bp, among which ۷۳ were polymorphic, with an average of ۸۲.۹ polymorphic bands per primer combination and average polymorphism information content (PIC) of ۰.۳۵. Based on the analysis of SRAP data, a similarity matrix was calculated according to the Dice coefficient. Similarity dendrogram was constructed using UPGMA algoritm. Cophenetic correlation between ultrametric similarities of tree and similarity matrix was found to be high (r=۰.۸۵, P < ۰.۰۰۰۱), suggesting that the cluster analysis strongly represents the dissimilarity matrix. According to the UPGMA dendrogram, the spinach accessions clustered into two groups. This preliminary study demonstrated that SRAP markers are effective for evaluating genetic diversity between and within spinach accessions.

کلیدواژه ها

تنوع ژنتیکی,(Spinacia oleraceae),اسفناج,SRAP

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.