بررسی کموانفورماتیکی و اندازه گیری فعالیت آزمایشگاهی لیگاندهای ممانعت کننده آنزیم سیکلواکسیژناز دو Cox۲ انسانی

مقدمه: مهار کننده های انتخابی آنزیم سیکلو اکسیژناز دو، نظیر سلوکو کسیب، روفوکوکسیب و والدوکسیب اخیرا به عنوان کاهنده های پاسخ های التهابی به کار می روند، با وجود این هنوز به مطالعات و تحقیقات بیشتری در زمینه مهار کننده های انتخابی Cox۲ نیاز است. این مطالعه در راستای معرفی ساختار های جدید با میل تر کیبی بیشتر به آنزیم Cox۲ می باشد. مواد و روش ها: سا ختار های شیمیا یی با ۸۰ درصد شباهت به سلو کو کسیب، از Pubchem در پایگاه اطلاعا تی NCBI استخراج و جمع آوری شد. فایل PDB آنزیم Cox۲ (۶COX) را د ر حا لت پیوند با لیگا ند SC-۵۵۸ به عنوان لیگاند مرجع، از سایت RCSB PDB به دست آمد. د اکینگ لیگا ند ها به جایگاه اتصال SC-۵۵۸ را با استفاد ه از نرم افزار FlexX, Lead IT اجرا شد و انرژی میان کنش های بین ترکیبات مختلف به دست آمد. مقدار IC۵۰ ترکیبات مورد نظر با استفاده از روش غربالگری آزمایشگاهی، بر علیه آنزیم Cox۲ تعیین شد. سرانجام با استفاده از روش سنجش MTT ، میزان سمیت سلولی ترکیبات مورد نظر تعیین شد. یافته های پژوهش: نتیجه غربالگری در پایگاه داده Pubchem، ۵۰۰۰ مولکول مشابه سلوکوکسیب بود. ۲۴ تا از ترکیبات امتیاز های انرژی بهتری نسبت به ۶COX باند شده با SC-۵۵۸ داشتند. لیگاند ها به پاکت پیو ند ی داک شد ند که با سرین ۳۵۳، آلانین ۵۲۷، وا لین ۵۲۳، متیونین ۵۲۲، فنیل آلانین ۵۱۸ و لوسین ۳۵۲ میان کنش نشان د اد ند. با بررسی چشمی، ترکیبات جهتگیری و حالت پیوندی مشابه با SC-۵۵۸ نشان داد ند.  بحث و نتیجه گیری: یافته های ما، رویه محاسباتی کشف ترکیبات جدید ضدالتهابی با فعالیت بیشتر و سمیت کمتر نسبت به مهارکننده های عمومی Cox۲ را قوت بخشید.

کلیدواژه ها:

Cox۲ ، Cox۲ selective inhibitors ، Docking ، MTT method ، آنزیم سیکلو اکسیژناز دو ، مهار کننده انتخابی سیکلو اکسیژناز دو ، داکینگ ، روش سنجش MTT