تشخیص، بررسی فیلوژنی و کلونینگ ژن G گلیکوپروتئین ویروس سپتی سمی هموراژیک (VHSV) جدا شده از ماهی قزل آلای رنگین کمان (Onchorhynchus mykiss)
- سال انتشار: 1399
- محل انتشار: فصلنامه محیط زیست جانوری، دوره: 12، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_AEJO-12-2_019
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 299
نویسندگان
گروه بهداشت و بیماری های آبزیان، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران
گروه بهداشت و بیماری های آبزیان، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران
گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران
گروه تشخیص بیماری های آبزیان، مرکز ملی تشخیص، آزمایشگاه های مرجع و مطالعات کاربردی، سازمان دامپزشکی کشور، تهران، ایران
گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران
چکیده
Viral hemorrhagic septicemia is one of the most important virus disease in salmonid fishes. The genome of the virus consists of six genes, the most important of which is the G glycoprotein gene, which plays a role in immunization against the virus. The aim of this study was detection of viral hemorrhagic septicemia virus in Rainbow trout, phylogenic study and cloning of the G gene of virus in pTZ۵۷r/t vector. Methods: After detecting of viral hemorrhagic septicemia virus by RT-PC, cloning of G gene in pTZ۵۷r/t plasmid, the recombinant plasmid was transformed to the competent bacterium (E. coli). White clonies containing recombinant vector were used to extract the plasmid. The size of the G gene of viral hemorrhagic septicemia virus was ۱۵۲۳ bp. In this study, colony PCR method and sequencing were used to confirm the cloning. Results: The results of this study showed that G gene has been cloned successfully in pTZ۵۷r/t vector and can be used to express the glycoprotein of the virus in expression vectors for protein production. The results of sequencing of G gene also showed that the virus identified in this study belonged to genotype Ia-۲.کلیدواژه ها
ویروس VHS, G گلیکوپروتئین, قزل آلای رنگین کمان, کلونینگاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.