فاطمه دیالمه پور - گروه شیمی دانشگاه آزاد اسلامی واحد شوشتر

طراحی و ساخت مهارکننده های موثر برای غیرفعال کردن آنزیم پالمیتویل کوآنزیم A هیدرولاز و مطالعه برهمکنش این آنزیم با مهارکننده ها با استفاده از روشهای محاسباتی در ارائه مدلی قابل قبول برای عملکرد میزان موثر بودن مهرکننده ها و نیز ارایه مکانیزمی برای عمل مهارکننده ها در رسیدن به مهارکنندگان موثرتر مفید و راه گشا خواهد بود در تحقیق حاضر اثر تعداد 3 مهارکننده به نامهای fmn وایبوپروفن، نیاسین برروی انزیم پالمیتوئیل کوآ با کد 3.1.2و2 و با استفاده از روش محاسباتی دینامیک مولکولی شبیه سازی و مطالعه گردید. شبیه سازی در شرایط شبیه شرایط فیزیولوژیک یعنی در محیط آبی درجه حرارت 37 درجه و فشار یک اتمسفر انجام گردید بعد از انجام دینامیک مولکولی پارامترهای مورد نیاز از فایل مسیر شبیه سازی استخراج و آنالیز نتایج انجام شد. مهارکننده فلاوین مونونوکلئوتید FMN با کاهش میزان ساختار نامنظم وافزایش ساختارهای منظم آلفا و بتا ضعیف ترین مهار کننده شناخته شدند.

آنزیم پالمیتویل کوآنزیم A هیدرولاز، مهارکننده، دینامیک مولکولی ، RMSD انحراف معیار جذب میانگین مربعات اسکلت پروتئین