بررسی ژنتیک جمعیت، فیلوژنی و تعیین خط شناسه DNA در لاک پشت سبز (Chelonia mydas) دریای عمان، سواحل استان سیستان و بلوچستان

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 297

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_AEJO-12-4_030

تاریخ نمایه سازی: 12 آبان 1400

چکیده مقاله:

در گذشته از صفات مورفولوژیکی برای طبقه ­بندی موجودات استفاده می­ کردند، اما امروزه استفاده از نشانگرهای مولکولی به ­دلیل مزیت ­هایی که دارد مورد توجه قرار گرفته است. نشانگرهای میتوکندریایی یکی از بهترین گزینه ­ها در بررسی روابط فیلوژنتیک است. در این مطالعه ۱۰ نمونه از لاک پشت دریایی سبز از سه منطقه چابهار ۴ نمونه، گواتر ۳ نمونه و کنارک  ۳ نمونه در استان سیستان و بلوچستان جمع ­آوری شد. پس از استخراج DNA با استفاده از کیت استخراج و هم ­چنین روش استخراج استات آمونیوم، نمونه ­ها از قطعه ژنی mtDNA و COI توالی­ یابی شدند. توالی ­ها به ­کمک نرم ­افزارهای MEGA، Bioedit و Arlequin بررسی شدند. نتایج نشان داد که براساس آنالیز فیلوژنتیکی جمعیت مورد مطالعه، نمونه ­ها در سه جمعیت قرار گرفتند. میانگین کلی فاصله در میان جمعیت براساس P-distance برابر با ۰/۱۸ بود. نتایج کلاستال دابلیو نشان داد که بیش ­ترین تفاوت میان توالی­ ها مربوط به ابتدا و انتهای توالی است. میزان تنوع هاپلوئیدی صفر بود. هم ­چنین تعداد محل ­های پلی­ مورفیک برابر با صفر بود که نشان می­ دهد تفاوت به اندازه ­ای نبوده که اشتقاق گونه انجام شود. هیچ نوترکیبی در توالی ­ها رخ نداده که با ماهیت ناحیه مورد بررسی هم­ خوانی داشته باشد. نتایج حاصل از این مطالعه را می ­توان در بررسی تنوع ژنتیکی لاک ­پشت ­های سبز دریایی در شرایط متفاوت جغرافیایی مورد استفاده قرار داد. هم ­چنین در مدیریت جمعیت این گونه، جلوگیری از انقراض آن و در تهیه یک بانک ژنی مناسب برای شناسایی این گونه به کمک تکنیک­ های مولکولی به ­ویژه در مواردی که فقط تخم یا بافت این گونه موجود است نیز می ­تواند یک راهکار مناسب باشد.

نویسندگان

سید احسان حیدری

گروه زیست شناسی دریا، دانشکده منابع طبیعی و محیط زیست، واحد واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران

محمد حسن شاه حسینی

گروه زیست شناسی دریا، دانشکده منابع طبیعی و محیط زیست، واحد واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران

هادی میراحمدی

گروه انگل شناسی، دانشگاه علوم پزشکی زاهدان، زاهدان، ایران

پرگل قوام مصطفوی

گروه زیست شناسی دریا، دانشکده منابع طبیعی و محیط زیست، واحد واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران

سید محمدرضا فاطمی

گروه زیست شناسی دریا، دانشکده منابع طبیعی و محیط زیست، واحد واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • افشاریان، ا.؛ نصیریان، م.؛ ابراهیمی، ا. و جوادمنش، ع.، ۱۳۸۶. ...
  • صفایی، ن. و مهدیزاده، و.، ۱۳۹۲. آموزش نرم ­افزارهای آنالیز ...
  • صمدی، س.، ۱۳۹۳. بررسی مورفولوژیک، فیلوژنی و تعیین خط شناسه ...
  • طبیب، م.، ۱۳۹۳. بررسی خصوصیات تولیدمثلی لاک ­پشت منقار عقابی ...
  • فریلند، ج. ۱۳۸۹. بوم شناسی مولکولی. ترجمه ملکیان، م.، مشهد، ...
  • قوام ­مصطفوی، پ.؛ شهنواز، ش.؛ نوروزی، م.؛ فاطمی، س.م.ر. و ...
  • لقمانی، م.، ۱۳۹۶. خصوصیات زیستی لاک ­پشت سبز، گونه در ...
  • مهدیزاده، و.؛ نساج­ حسینی، م.؛ صفایی، ن. و سعیدی، ع.، ...
  • نساج ­حسینی،م. و شمس ­بخش، م.، ۱۳۸۹. روش ­های آنالیز ...
  • Asensio, G.L., ۲۰۰۷. PCR-based methods for fish and fishery products ...
  • Avise, J.C. and Ball Jr, R.M., ۱۹۹۰. Principles of genelogical ...
  • Balakrishnan, R., ۲۰۰۴. Species Concepts, Species Boundaries and Species Identification: ...
  • Blaxter, M.L., ۲۰۰۴. The promise of a DNA taxonomy. Phil. ...
  • Bowen, B.W.; Meylan, A.B.; Ross, J.P.; Limpus, C.J.; Balazs, G.H. ...
  • Dawkins, R., ۱۹۷۶. The selfish gene. Oxford, New York: Oxford ...
  • Hebert, P.D.N.; Cywinska, A.; Ball, S.L. and deWaard, J.R., ۲۰۰۳. ...
  • Lemey, P.; Salemi, M. and Vandamme, A.M., ۲۰۰۹. The phylogenetic ...
  • Spotila, J., ۲۰۰۴. Sea Turtles: A Complete Guide to their ...
  • نمایش کامل مراجع