DNA Sequence Fragment Containing C to A Mutation as a Convenient Mutation Standard for DHPLC Analysis

  • سال انتشار: 1392
  • محل انتشار: مجله علوم پایه پزشکی ایران، دوره: 16، شماره: 8
  • کد COI اختصاصی: JR_IJBMS-16-8_011
  • زبان مقاله: انگلیسی
  • تعداد مشاهده: 173
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

Hassan Dastsooz

۱Department of Medical Genetics, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran

Nazanin Vahedi

۱Department of Medical Genetics, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran

Majid Fardaei

۱Department of Medical Genetics, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran

چکیده

Objective(s):  Denaturing high performance liquid chromatography (DHPLC) is a high throughput approach for screening DNA sequence variations. To assess oven calibration, cartridge performance, buffer composition and stability, the WAVE Low and High Range Mutation Standards are employed to ensure reproducibility and accuracy of the chromatographic analysis. The purpose of this study was to provide a cost-effective homemade mutation standard for DHPLC analysis. Materials and Methods: DHPLC was performed to evaluate different elution temperatures of a ۳۷۴ bp DNA fragment with C> A mutation at position of ۵۹ to achieve a peak profile similar to the Low Mutation Standard. In order to verify the reproducibility of the homemade mutation standard using DHPLC, ۱۵ different experiments were performed to compare the homemade mutation standard, the WAVE Low Range Mutation Standard with a positive DNA control sample. Results:We identified a comparable elution temperature and a peak profile with the WAVE Low Range Mutation Standard. Conclusion: This study confirmed the reproducibility of the peak profile of our homemade mutation standard compared to the Low Mutation Standard using DHPLC analysis.

کلیدواژه ها

ATP۷B DHPLC Low range mutation stan- dar

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.