کارایی نشانگرهای EST-SSR در تعیین تنوع و ساختار ژنتیکی توده های بومی جو
محل انتشار: فصلنامه تحقیقات غلات، دوره: 2، شماره: 2
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 288
فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_CRGU-2-2_001
تاریخ نمایه سازی: 3 آبان 1400
چکیده مقاله:
تودههای بومی از ذخایر ژنتیکی با ارزش در برنامههای اصلاحی گیاهان زراعی میباشند. تعیین سطح تنوع و روابط ژنتیکی بین تودههای بومی، لازمه حفاظت و بهرهبرداری بهینه از این منابع با ارزش است. در پژوهش حاضر، تنوع و روابط ژنتیکی ۱۱۹ توده بومی و ۲۵ لاین پیشرفته و تجاری جو از کشورهای ایران، چین، مصر، روسیه، پاکستان و اسپانیا با استفاده از ۲۲ جفت آغازگرEST-SSR بررسی شد. در مجموع، ۸۷ آلل در ۲۱ جایگاه EST-SSR، با میانگین ۱۴/۴ آلل به ازای هر جایگاه تکثیر شد. میزان اطلاعات چندشکلی از ۲۳/۰ (GBM۱۲۱۲) تا ۸۴/۰ (SCSSR۰۹۳۹۸) با میانگین ۵۲/۰ متغیر بود. نشانگرهای مورد مطالعه، دارای میانگین تنوع ژنی ۵۸/۰ با دامنه ۲۴/۰ تا ۸۶/۰ بودند. تجزیه خوشهای بر اساس دادههای EST-SSR و با استفاده از الگوریتم Neighbor-Joining و ضریب فاصله تکاملی Kimura ۲-Parameter، ژنوتیپها را به پنج گروه منتسب کرد. در تجزیه به بردارهای اصلی، سه بردار اول در مجموع ۰۹/۷۰ درصد از تغییرات مولکولی کل بین ژنوتیپها را تبیین کردند. نمایش دو بعدی ژنوتیپها بر اساس دو بردار اصلی اول، گروهبندی حاصل از تجزیه خوشهای را تائید کرد. بر اساس تجزیه واریانس مولکولی، تنوع ژنتیکی بالایی درون گروههای جغرافیایی مشاهده شد که میتواند در برنامههای اصلاح جو استفاده شود. نتایج نشان داد که نشانگرهای EST-SSR به عنوان نشانگرهای عملکردی از کارایی مناسبی برای بررسی روابط ژنتیکی ژتوتیپها و تعیین ساختار جمعیتها برخوردار هستند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
نیر عبدالهی سیسی
گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز
سید ابوالقاسم محمدی
گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز و قطب علمی اصلاح مولکولی غلات دانشگاه تبریز
سید سیامک علوی کیا
گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز
بهزاد صادق زاده
موسسه تحقیقات دیم کشور