تنوع آللی ژن های زیرواحدهای گلوتنین با وزن مولکولی پایین در گندم های پاییزه بومی ایران
- سال انتشار: 1395
- محل انتشار: فصلنامه تحقیقات غلات، دوره: 6، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_CRGU-6-1_006
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 317
نویسندگان
دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
استاد، گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز، تبریز، ایران; قطب علمی اصلاح مولکولی غلات، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
استادیار، گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
استاد، گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
چکیده
در این مطالعه، تنوع آللی ژن های زیرواحدهای گلوتنین با وزن مولکولی پایین در ۱۹۳ گندم بومی پاییزه ایرانی و رقم Thatcher با استفاده از آغازگرهای اختصاصی بررسی شد. بر اساس جفت آغازگر Glu۳A.۲، هشت قطعه با اندازه ۳۵۸-۳۱۵ جفت باز تکثیر شد، به طوری که آلل ۳۴۲ جفت بازی با ۲/۳۷ درصد بیشترین و آلل ۳۱۵ جفت بازی با ۶/۰ درصد کمترین فراوانی را به خود اختصاص دادند. جفت آغازگر Glu۳A.۳ نیز پنج قطعه در محدوده ۷۵۴-۶۳۸ جفت باز تکثیر کرد که در بین آنها، آللهای ۷۰۰ و ۷۴۲ جفت بازی به ترتیب با ۱/۹۲ درصد و ۶/۰ درصد بیشترین و کمترین فراوانی را داشتند. دو قطعه به طول ۴۴۰ و ۴۲۱ جفت باز به ترتیب با فراوانی ۶/۷۴ و ۴/۲۵ درصد با استفاده از جفت آغازگر Glu۳B.۲ تکثیر شد. جفت آغازگر Glu۳D.۲ سه قطعه با اندازه ۵۷۱، ۵۵۸ و ۳۸۲ جفت باز به ترتیب با فراوانی ۷/۱، ۱/۸۸ و ۲/۱۰ درصد تکثیر کرد. شش آلل تکثیر شده توسط جفت آغازگر Glu۳D.۳ نیز دارای اندازهای در محدوده ۵۸۹ تا ۶۱۱ جفت باز و فراوانی بین ۹/۲۷-۲/۱ درصد بودند. با استفاده از جفت آغازگر Glu۳D.۴، فقط یک قطعه با اندازه ۷۰۰ جفت باز تکثیر شد. متوسط محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) برای تمامی آغازگرهای مطالعه شده، ۲۴/۰ بهدست آمد که در بین آنها، آغازگرهای Glu۳A.۲ و Glu۳D.۳ با میزان ۷۵/۰ بیشترین و آغازگر Glu۳A.۳ با میزان ۱۵/۰ کمترین محتوای اطلاعات چندشکلی را نشان دادند. تنوع ژنی یا هتروزیگوسیتی مورد انتظار نیز از ۱۵/۰ تا ۷۸/۰ با میانگین ۲۶/۰ متغیر بود. تجزیه خوشهای با استفاده از الگوریتم Neighbor-Joining ارقام گندم پاییزه را به دو گروه تفکیک کرد. تجزیه واریانس مولکولی با تفکیک ارقام مورد مطالعه بر اساس شرایط اقلیمی به پنج منطقه شامل سرد، کوهستانی، معتدل، گرم و خشک، نشان دهنده سهم بیشتر واریانس درون گروهی (۹۴ درصد) در مقایسه با واریانس بین گروهی (۶ درصد) در تبیین واریانس مولکولی کل بود. نتایج این تحقیق نشان داد که توده های بومی گندم ایران ذخایر ژنتیکی متنوع و ارزشمندی از نظر ژن های کنترل کننده صفات مرتبط با کیفیت نانوایی هستند.کلیدواژه ها
آغازگر اختصاصی, تجزیه واریانس مولکولی, توده بومی, پروتئین ذخیره ایاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.