بررسی تنوع ژنتیکی نمونه ای از ژرم پلاسم جو وحشی (Hordeum spontaneum) با استفاده از نشانگر مولکولی SSR
- سال انتشار: 1395
- محل انتشار: فصلنامه تحقیقات غلات، دوره: 6، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_CRGU-6-2_006
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 345
نویسندگان
دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
استادیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
استادیار، گروه باغبانی، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
استادیار، گروه کشاورزی دانشگاه پیام نور، تهران، ایران
دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
دانشجوی دکتری، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
چکیده
تعیین سطح تنوع ژنتیکی و روابط بین ژنوتیپها جهت شناسایی والدین مناسب برای اهداف اصلاحی مختلف ضروری است. در این تحقیق، روابط ژنتیکی ۵۵ نمونه از ژرمپلاسم جو وحشی اسپونتانئوم (Hordeum spontaneum) متعلق به مناطق مختلف جهان با استفاده از ۱۴ جفت آغازگر ریزماهواره بررسی شد. در مجموع ۵۳ آلل با میانگین ۲/۵ آلل به ازای هر جفت آغازگر تکثیر شد. میانگین فراوانی آلل رایج ۵۱/۰ بود. میزان اطلاعات چند شکلی در دامنه ۳۷/۰ تا ۸۱/۰ با میانگین ۶۳/۰و تنوع ژنی یا هتروزیگوسیتی مورد انتظار در محدوده ۳۸/۰ تا ۸۲/۰ با میانگین ۶۴/۰ بود. نتایج حاصل از ارزیابی شاخصهای تنوع نشان داد که نشانگرهای Bmag۰۰۷، EBmac۰۷۰۱ و Bmac۱۳۴ مناسبترین نشانگرها برای تفکیک ژنوتیپها بودند. تجزیه خوشهای با روش UPGMA بر اساس دادههای مولکولی، ژنوتیپها را به شش گروه تقسیم کرد. ژنوتیپهای موجود در هر یک از گروهها، عموما از یک منطقه جغرافیایی خاص جمعآوری شده بودند. در تعدادی از نمونهها نیز تطابق بین توزیع جغرافیایی با گروهبندی ژنوتیپها مشاهده نشد. بر اساس نتایج، بیشترین شباهت را ژنوتیپهای سوریه و اردن و کمترین شباهت را نمونههای قزاقستان با این دو کشور داشتند. نتایج این تحقیق وجود تنوع ژنتیکی قابل توجه در نمونههای جو وحشی مورد مطالعه را نشان داد که با شناسایی ژنهای مفید، میتوان از آنها جهت اصلاح و بهبود ارقام زراعی استفاده کرد.کلیدواژه ها
تجزیه خوشه ای, چندشکلی, هتروزیگوسیتیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.