بررسی الگوی عدم تعادل لینکاژی و مطالعه ارتباط ژنومی هاپلوتیپی جهت شناسایی مناطق ژنومی موثر بر دو قلوزایی در گوسفندان نژاد بلوچی
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: فصلنامه پژوهشهای تولیدات دامی، دوره: 5، شماره: 10
- کد COI اختصاصی: JR_RAP-5-10_014
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 137
نویسندگان
Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
University of Tehran
چکیده
دوقلوزایی از صفات مهم اقتصادی در پرورش گوسفند میباشند. صفات تولیدمثلی نه تنها در بین نژادهای مختلف گوسفند بلکه در بین گوسفندان یک نژاد نیز دارای تفاوتهای عمده میباشند. در این تحقیق مطالعه الگوی عدمتعادل لینکاژی و ارتباط ژنومی هاپلوتیپی با استفاده از ۴۲۴۱۶ نشانگر تکنوکلئوتیدی برای شناسایی نواحی ژنومی موثر بر نرخ دوقلوزایی در گوسفند بلوچی انجام شد. نمونههای خون از ۹۶ راس گوسفند بلوچی همراه با دادههای فنوتیپی مرتبط به صفات زایش و رشد متعلق به دو گله از ایستگاه تحقیقاتی عباسآباد تهیه شد. نمونهها با استفاده از ریزآرایههای نانویی گوسفندی ( ۵۰K ) تعیین ژنوتیپ شدند. با استفاده از نرمافزار PLINK ماتریس خویشاوندی IBS و هاپلوتیپها برای افراد محاسبه و مطالعه ارتباط هاپلوتیپها برای نرخ دوقلوزایی برای ۴ شکم زایش با در نظر گرفتن بعد اول آزمون MDS و اثر گله بهعنوان متغیر کمکی انجام شد. برای کنترل نرخ اشتباه در سطح خانواده، از تصحیح بنفرونی استفاده شد. ارتباط معنیدار پیشنهادی برای هاپلوتیپها روی کروموزومهای ۱، ۱۰ و ۱۵ شناسایی شد. مقدار عدم تعادل لینکاژی با استفاده از آماره r۲ بین تمام جفت لوکوس ها محاسبه شد.. در فاصله کمتر از ۱۰ Kb میانگین r۲ برابر ۳۳/۰ بوده و برای نشانگرهای با فاصله ۲۰۰ تا ۵۰۰ کیلو باز میانگین r۲ ۰۸۶/۰ بود. مقدار عدم نعادل لینکاژی در گوسفند بلوچی نسبت به آنچه در گاو شیری گزارش شده کمتر بوده و مشابه دیگر جمعیتهای کوسفند می باشد. مطالعه بیشتر این نواحی در شناسایی ژنهای کاندید دوقلوزایی در گوسفند کمک شایانی خواهد نمود.کلیدواژه ها
Twining, Sheep, LD, Haplotype, Genomic wide association, دو قلوزایی, گوسفند, LD, هایپلوتیپ, پویش ژنومیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.