آنالیز بیان افتراقی ژن ها در پاسخ به عصاره لیپوپلی ساکاریدی ازباکتری اشیرشیاکولای در سلول های اپی تلیال اندومتریوم گاوی
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: فصلنامه پژوهشهای تولیدات دامی، دوره: 8، شماره: 18
- کد COI اختصاصی: JR_RAP-8-18_015
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 291
نویسندگان
چکیده
لیپوپلیساکارید۱(LPS)، بخشی از ساختار غشای بیرونی باکتریهای گرم منفی است که در فرآیندهای پاتوژنی که منجر به ورم پستان و التهاب رحم در گاوهای شیری میشود، دخالت دارد. همچنین LPS باعث التهاب اندومتریوم و شکست لانهگزینی در بسیاری از گونههای حیوانی میشود. باتوجه به اهمیت اقتصادی این بیماریها در صنعت گاو شیری، آنالیز بیان افتراقی ژنها و شناسایی مسیرهای مرتبط در پاسخ به عصاره لیپوپلیساکاریدی از باکتری اشیرشیاکولای با استفاده از آنالیز ترانسکریپتوم برای فهم مکانیسم دقیق این فرآیند بسیار حیاتی و ضروری است. در این پژوهش، بعد از مراحل جداسازی و تیمار سلولهای اپیتلیال اندومتریوم گاو با دوزهای مختلفی ازLPS (صفر، ۲ و ۸ میلیگرم بر میلیلیتر) در محیط کشت، RNA کل استخراج و برای تهیه کتابخانه ترانسکریپتومی مورد استفاده قرار گرفت. در مجموع ۱۲ کتابخانه ترانسکریپتومی از سه گاو قرمز سوئدی (۴ نمونه به ازای هر راس گاو) توسط تکنولوژی با توان عملیاتی بالا تعیین توالی و آنالیز بیان افتراقی ژنها و همچنین مسیرهای بیولوژیکی مرتبط مورد شناسایی قرار گرفتند. نتایج این پژوهش نشان داد در مجموع ۲۰۳۵ ژن در بین گروههای شاهد و تیمار شده با LPS دارای بیان متفاوت بوده که تعداد ۷۵۲ ژن در مسیر تکثیر و مرگ سلولی نقش داشتند. همچنین نتایج شمارش سلولهای اپیتلیال نشان داد که عصاره لیپوپلیساکاریدی توانست بهطور معنیداری باعث افزایش تکثیر سلولی شود. آنالیز مسیرهای بیولوژیکی نشان داد که این ژنها در تعدادی از مسیرهای سیگنالی از جمله سیستم ایمنی شامل مسیر سیگنالی Toll-Like Receptor، T Cell Receptor، MAPK، شیموکینها، سرطان اندومتریوم رحمی و همچنین مسیر سیگنالی مرگ و تکثیر سلولی دخالت دارند. طبق اطلاعات ما این مطالعه، نخستین تحقیقی است که روی سلولهای اپیتلیال اندومتریوم گاوی انجام شده است که میتواند درک ما را در ارتباط با مکانیسمهای مرتبط به التهابهای ناشی از عفونتهای رحمی در گاو شیری افزایش دهد.کلیدواژه ها
Biological Pathways, Endometrial, Epithelial Cells, Cell Proliferation, Lipopolysaccharide, Transcriptome Analysis, آنالیز ترانسکریپتوم, تکثیر سلولی سلول های اپی تلیال اندومتریوم, لیپوپلی ساکارید, مسیرهای بیولوژیکیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.