طراحی پرایمرهای اختصاصی برای مطالعه تنوع تک نوکلئوتیدی (SNP) در ژن ها و تعیین عملکرد آنها
- سال انتشار: 1394
- محل انتشار: پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، دوره: 7، شماره: 16
- کد COI اختصاصی: JR_JCB-7-16_016
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 217
نویسندگان
دانشگاه بین المللی امام خمینی قزوین
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی کرج
پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی کرج
پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی کرج
چکیده
اطلاعات زیادی در مورد توالی بسیاری از ژنها بدون آنکه عملکرد این توالیها شناخته شده باشد، وجود دارد. از این رو تحقیقات فراوانی از طریق روشهای ژنتیکی معکوس برای پر کردن شکاف بین ساختار و عملکرد این توالیها انجام گرفته است. بدین منظور آزمایشی با هدف چگونگی طراحی پرایمرهای اختصاصی ژن، که بتوانند تنوع تک نوکلئوتیدی و تاثیر آن بر عملکرد ژن را تعیین نمایند، در مرکز بین المللی تحقیقات کشاورزی در مناطق خشک (ICARDA) انجام گرفته است. ژنهای مورد بررسی در این آزمایش دو ژن متحمل به تنش شوری در جو، CBL۴ و HvHKT۱، بوده است و هشت جفت پرایمر برای این دو ژن طراحی گردید. کارآیی پرایمرها برای تکثیر منطقه مورد نظر و نشان دادن تنوع تک نوکلئوتیدی از طریق واکنش زنجیرهای پلیمراز۱ و توالی یابی قطعات تکثیری مورد ارزیابی قرار گرفت. همه پرایمرهای طراحی شده دارای قابلیت بالایی از نظر تکثیر قطعات ژنومی مربوط و تعیین تنوع تک نوکلئوتیدی بودند. این پرایمرها اختصاصی بوده و از مناطق کدکننده ژن طراحی شدند. لذا به کمک آنها میتوان نقش تنوع نوکلئوتیدی موجود بین ژنوتیپهای مختلف در تغییر عملکرد ژن را مورد مطالعه قرار داد. همچنین انتخاب به کمک این مارکرهای اختصاصی دارای کارآیی بیشتری نسبت به انتخاب بر اساس مارکرهای پیوسته با ژن میباشد.کلیدواژه ها
Gene Specific Primer, Single nucleotide variation, Barley, CBL۴ and HvHKT۱, پرایمر اختصاصی ژن, تنوع تک نوکلئوتیدی, جو, CBL۴, HvHKT۱اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.