ارزیابی تنوع ژنتیکی بین و درون تیپ های مختلف توتون با استفاده از نشانگرهای IRAP و REMAP
- سال انتشار: 1394
- محل انتشار: پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، دوره: 7، شماره: 16
- کد COI اختصاصی: JR_JCB-7-16_001
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 265
نویسندگان
دانشگاه گیلان،
دانشگاه گیلان،
مرکز تحقیقات توتون گیلان
چکیده
در این مطالعه بهمنظور بررسی تنوع ژنتیکی ۴۵ ژنوتیپ از ژرمپلاسم تیپهای مختلف توتون شامل گرمخانهای، بارلی و شرقی، از ۲۰ ترکیب آغازگری IRAP و REMAP استفاده شد که از بین این آغازگرها، ۵ آغازگر IRAP و ۹ آغازگر REMAP قادر به تولید الگوی نواری، با وضوح و چندشکلی بالا بودند و در مجموع ۱۸۸ مکان را تکثیر کردند که از این تعداد ۱۵۳ مکان، چندشکل بودند. آغازگر RTR-۱۰ با ۲۲ نوار و RTR-۱ با ۱۶ نوار، بیشترین و آغازگر UBC۸۱۷+RTR۱ با ۴ نوار، کمترین تعداد مکانهای چند شکل را تکثیر کردند. میزان اطلاعات چندشکل نشانگرها بین ۱۶/۰ تا ۳۳/۰ و شاخص نشانگر از ۳۴/۰ تا ۲۵/۶ در کل ژنوتیپهای مورد مطالعه متغیر بود. تجزیه خوشهای به روش UPGMA، ۴۵ ژنوتیپ مورد مطالعه را در پنج گروه قرار داد، که گروه اول شامل تیپ بارلی، گروه دوم شامل تیپ گرمخانهای و گروههای ۳، ۴ و ۵ شامل ژنوتیپهای شرقی شدند. صحت گروهبندی حاصل از تجزیه خوشهای توسط تابع تشخیص کانونی به روش خطی فیشر ۳/۷۳ درصد تایید شد.کلیدواژه ها
Retrotransposon, Simple Matching Coefficient, Polymorphism InformationContect, رتروترانسپوزون, ضریب تشابه انطباق ساده, میزان اطلاعات چندشکلاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.