شناسایی و کلون سازی خانواده ژنی چالکون سنتاز گیاه خار مریم (Silybum marianum L.)
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 4، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_JOAGK-4-1_004
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 188
نویسندگان
فارغ التحصیل کارشناسی ارشد اصلاح نباتات پردیس ابوریحان دانشگاه تهران، استان تهران، شهرستان پاکدشت.
استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات پردیس ابوریحان دانشگاه تهران، استان تهران، شهرستان پاکدشت
استادیار بخش فیزیولوژی مولکولی پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، استان البرز، کرج
دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات پردیس ابوریحان دانشگاه تهران، استان تهران، شهرستان پاکدشت
استادیار بخش فیزیولوژی مولکولی پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، استان البرز، کرج.
چکیده
سیلیمارین یک ترکیب فلاونوئیدی است که از دانه های گیاه خارمریم بهدست میآید و دارای خواص دارویی متعددی می باشد. چالکونسنتاز نقش کلیدی در مسیر بیوسنتزی فلاونوئیدها دارد بنابراین شناسایی ژن رمزده آن گامی مهم در مهندسی متابولوم گیاه خارمریم می باشد. بدینمنظور پس از جمع آوری داده های توالی موجود در مورد خانواده ژنی چالکونسنتاز در سایر گیاهان، همردیفی آنها و تعیین نواحی حفظ شده، چهار آغازگر دژنره بر اساس این نواحی طراحی شد. قطعات ژنی تکثیر شده در PCR با استفاده از این جفت آغازگر از ژنوتیپ بومی منطقه برازجان و رقم اصلاح شده مجار در ناقل مناسب همسانه سازی و سپس تعیین توالی شدند. مطالعه توالی نوکلئوتیدی حاصل و توالی اسیدآمینه ای آنها، منجر به شناسایی دو عضو از خانواده ژنی چالکونسنتاز در این گیاه گردید. بر اساس نقاط متنوع، شش آغازگر اختصاصی برای هریک از اعضا جهت تکثیر cDNA از روی RNAی کل رقم مجار درسیستمRACE طراحی شد. قطعات cDNAی تکثیر شده در۳'RACE و۵'RACE در ناقل مناسب همسانه سازی و سپس تعیین توالی شدند. توالی کامل cDNAی ژن چالکون سنتاز از همپوشانی توالیهای۵'RACE و ۳'RACE عضو یک شناسایی گردید که قالب باز خواندنی آن دارای ۱۲۳۹ باز بوده و شامل اگزون یک (۱۹۰ باز) و اگزون دو (۱۰۴۹ باز) می باشد که به ترتیب ۶۳ و ۳۴۹ اسیدآمینه را رمز میکنند. مطالعه کل توالی های نوکلئوتیدی و اسیدآمینه ای بهدست آمده، منجربه شناسایی سه عضو از خانواده ژنی چالکونسنتاز در این گیاه برای اولین بار شد که دارای دومینهای حفظ شده انتهای آمین و کربوکسیل چالکون سنتاز می باشندکلیدواژه ها
چالکون سنتاز, خارمریم, همسانه سازی, RACE, تعیین توالیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.