واریانت های جدید ویروئید شماره سه مرکبات استان فارس

سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 116

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-3-1_001

تاریخ نمایه سازی: 12 مهر 1400

چکیده مقاله:

ویروئید شماره سه مرکبات (Citrus viroid-III= CVd-III) دامنه میزبانی محدودی داشته و علائم اختصاصی در بالنگ اتراگ ایجاد می­کند که شامل ایجاد چین و چروک در دمبرگ، قهوه ای شدن و خمیدگی برگ، پژمردگی و کجی برگ به خاطر نکروز نقطه ای رگبرگ میانی می باشد. ویروئید شماره سه مرکبات باعث کاهش معنی دار قطر تنه درختان پیوندی والنسیا و پایه نارنج سه برگچه ای و حجم سایه انداز درختان آلوده می گردد. در این مطالعه، تعدادی نمونه بدون علائم مشخص از باغ های مرکبات استان فارس از نظر وجود ویروئید، مورد بررسی قرار گرفتند. پس از استخراج آر. ان. ای. از گیاه، به وسیله واکنش زنجیره ای پلیمراز با نسخه برداری معکوس، همسانه سازی و تعیین توالی ژنوم کامل، ویروئیدهای موجود در نمونه های آلوده بررسی گردیدند. در ادامه از نظر مولکولی (ترکیب نوکلئوتیدی، ساختمان اولیه و ثانویه، وزن مولکولی، روابط فیلوژنتیکی و درصد تشابه نوکلئوتیدی)، مقایسه ای بین واریانت های موجود انجام گرفت. در این مطالعه سه واریانت جدید CVd-III (واریانت های شماره ۱، ۲ و ۳) از باغ های مرکبات استان فارس ردیابی گردید. از نظر ترادف نوکلئوتیدی، تشابه CVd-III-۲ و  CVd-III-۳ بسیار زیاد (۹۹%) است ولی این دو واریانت فقط ۹۳% با CVd-III-۱ شباهت دارند. گروه بندی فیلوژنتیکی نیز نشان داد که CVd-III-۲ و  CVd-III-۳ به همراه CVd-III-۱۱ (گزارش شده از فلسطین اشغالی) و  CVd-III-۱۲(گزارش شده از ایالات متحده آمریکا) در یک گروه و CVd-III-۱ به همراه CVd-III-a در گروه دیگری قرار می­گیرند که امر تفاوت در منشا تکامل واریانت های موجود در استان فارس را نشان می دهد.

نویسندگان

علی اکبر باقریان

عضو هیئت علمی دانشگاه جهرم و دانشجوی دکترای دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز

کرامت اله ایزدپناه

مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Alavi M, Hashemi Sohi H, Ahoomanesh A, Rahimian H (۲۰۰۵). ...
  • Alavi SM, Ahoonmanesh A, Rahimian H (۲۰۰۶). Nucleotide sequence of ...
  • Bernad L, Duran-Vila N (۲۰۰۶). A novel RT-PCR approach for ...
  • Diener TO (۱۹۷۲). Viroids and Viroid Diseases. John-Wiley and Sons. ...
  • Elleuch A, Khouaja FD, Hamdi I, Bsais N, Perreault JP, ...
  • Gora-Sochacka A (۲۰۰۴). Viroids: Unusual small pathogenic RNAs. Acta Biochimia ...
  • Holmes DS, Quigley M (۱۹۸۱). A rapid boiling method for ...
  • Owens RA, Yang G, Gundersen-Rindal D, Hammond RW, Candresse T, ...
  • Roistacher CN, Bash JA, Semancik JS (۱۹۹۳). Distinct disease symptoms ...
  • Saitou N, Nei M (۱۹۸۷). The neighbor-joining method: a new ...
  • Serra P, Gago S, Duran-Vila N (۲۰۰۸). A single nucleotide ...
  • Tabler M, Tsagris M (۲۰۰۴). Viroids: Petite RNA pathogens with ...
  • Yang X, Hadidi A, Garnsey SM (۱۹۹۲). Enzymatic cDNA amplification ...
  • نمایش کامل مراجع