تنوع ژنتیکی جایگاه های TLR۴ و IL۲ دخیل در سیستم ایمنی در چند نژاد مرغ بومی ایران

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 253

فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_RAP-9-21_015

تاریخ نمایه سازی: 4 مهر 1400

چکیده مقاله:

در این تحقیق چندشکلی های­ آللی در ژن­های کاندید TLR۴ و IL۲ دخیل در سیستم ایمنی برخی از نژادهای مرغ­ بومی با استفاده از تکنیک PCR-RFLP بررسی شد. ۲۰۰ قطعه مرغ شامل نژاد­های مرغ بومی عمومی، آذربایجان غربی، مرندی و مازندرانی انتخاب شدند. برای شناسایی جهش در ژن­ های TLR۴ و IL۲ به ترتیب از آنزیم ­های Sau۹۶I و HphI استفاده شد. برای جایگاه ژنی ۲۵۷ جفت بازی TLR۴، بعد از هضم آنزیمی سه ژنوتیپ CC، CG و GG شناسایی و برای آلل C دو باند ۱۳۸ و ۱۱۹ جفت بازی و برای آلل G سه باند ۱۱۹، ۹۹ و ۳۹ جفت بازی مشاهده شد. در جایگاه ژنی ۶۰۰ جفت بازی IL۲، سه ژنوتیپAA ، AB و BB شناسایی و برای آلل A چهار باند ۴۶۵، ۶۴، ۴۰ و ۳۱ جفت بازی و برای آلل B پنج باند ۴۵۴، ۶۴، ۴۰، ۳۱ و ۱۱ جفت بازی مشاهده شد. کل جمعیت­ ها از نظر شاخص تعادل برای دو جایگاه ژنی مورد مطالعه در تعادل هاردی - واینبرگ قرار داشت. شاخص اطلاعات شانون در جایگاه ­های نشانگری TLR۴ و IL۲ به ترتیب ۵۶/۰ و ۶۹/۰ و همچنین شاخص تثبیت به ترتیب ۰۵/۰- و ۱۰/۰- محاسبه شد. بیشترین مقدار شاخص هتروزیگوسیتی مشاهده شده برای جایگاه­ های ژنی TLR۴ و IL۲ به ترتیب ۵۵/۰ و ۴۰/۰ برآورد شد. با توجه به چندشکلی های موجود در جایگاه ­های ژنی مطالعه شده و کاهش هتروزیگوسیتی در این جمعیت­ ها، می ­توان از بروز تلاقی ­های غیر تصادفی جلوگیری کرد. این امر منجر به افزایش هتروزیگوسیتی و در نتیجه مانع از کاهش تنوع ژنتیکی در جمعیت­ ها خواهد شد. همچنین با مطالعه­ ی پاسخ­ های ایمنی مرتبط با این دو جایگاه ژنی می ­توان از این جایگاه به ­عنوان نشانگرهای مناسب در برنامه­ های اصلاح نژاد مرغ­ های بومی برای افزایش مقاومت به بیماری­ ها بهره برد.  

کلیدواژه ها:

Polymorphism ، TLR۴ and IL۲ genes ، indigenous chicken ، PCR-RFLP ، چند شکلی ، ژن های TLR۴و IL۲ ، مرغ بومی ، PCR-RFLP

نویسندگان

جعفر پیش جنگ آقاجری

دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، دانشکده ی علوم دامی وشیلات، گروه علوم دامی، ساری، ایران و عضو هیات علمی

قدرت اله رحیمی میانجی

دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، دانشکده ی علوم دامی وشیلات، گروه علوم دامی، ساری

سید حسن حافظیان

دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، دانشکده ی علوم دامی وشیلات، گروه علوم دامی، ساری

محسن قلی زاده

دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، دانشکده ی علوم دامی وشیلات، گروه علوم دامی، ساری

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Al-Atiyat, R. ۲۰۱۰. Genetic diversity of indigenous chicken ecotypes in ...
  • Alinaghizadeh, H., M.R. Mohammad Abadi and S. Zakizadeh. ۲۰۱۰. Exon ...
  • Allendorf, F.W. and R.F. Leary. ۱۹۸۶. Heterozygosity and fitness in ...
  • Bulumulla, P.B.A.I.K., P. Silva and H. Jianlin. ۲۰۱۱. Genetic diversity ...
  • Corander, J., P. Waldmann and M.J. Sillanpää. ۲۰۰۳. Bayesian analysis ...
  • Estess, P., A. Nandi, M. Mohamadzadeh and M.H. Siegelman. ۱۹۹۹. ...
  • Hemati, B., M.H. Banabazi, S. Shahkarami, E. Mohandesan and P. ...
  • Jaiswal, G., S. Kumar, Y. Prasad and D.P. Singh. ۲۰۰۹. ...
  • Javanmard, A., M.R. Mohammadabadi, G.E. Zarrigabayi, A.A. Gharahedaghi, M.R. Nassiry, ...
  • Keller, L.F. and D.M. Waller. ۲۰۰۲. Inbreeding effects in wild ...
  • Kogut, M., L. Rothwell and P. Kaiser. ۲۰۰۳. Priming by ...
  • Köllisch, G., B.N. Kalali, V. Voelcker, R. Wallich, H. Behrendt, ...
  • Kumar, R., S. Kumar, D.P. Singh and P. Gaur. ۲۰۰۷. ...
  • Levene, H. ۱۹۴۹. On a matching problem in genetics. The ...
  • Leveque, G., V. Forgetta, S. Morroll, A.L. Smith, N. Bumstead, ...
  • Maghsoudi, S.M. and A. Pakdel. ۲۰۰۸. Review of effective genetical ...
  • McDonald, D.G. and J. Dimmick. ۲۰۰۳. The conceptualization and measurement ...
  • Miller, S.A., D.D. Dykes and H.F. Polesky. ۱۹۸۸. A simple ...
  • Moazeni, S., M.R. Mohammadabadi, M. Sadeghi, H. Shahrbabak, A. Koshkoieh ...
  • Association of the melanocortin-3(MC3R) receptor gene with growth and reproductive traits in Mazandaran indigenous chicken [مقاله ژورنالی]
  • Mohammadabadi, M.R., M. Nikbakhti, H.R. Mirzaee, A. Shandi, D.A. Saghi, ...
  • Mohammadi, A., M.R. Nassiry, J. Mosafer, M.R. Mohammadabadi and G.E. ...
  • Mohammadifar, A. and M.R. Mohammadabadi. ۲۰۱۱. Application of microsatellite markers ...
  • Mousavizadeh, A., M.R. Mohammadabadi, A. Torabi, M.R. Nassiry, H. Ghiasi ...
  • Nei, M. ۱۹۷۳. Analysis of gene diversity in subdivided populations. ...
  • Nikoubin Borujeni, M., N. Pirany and F. Rafiei Boroujeni. ۲۰۱۶. ...
  • Ramasamy, K.T., M.R. Reddy and S. Murugesan. ۲۰۱۱. Toll-like receptor ...
  • Association of growth trait and Leptin gene polymorphism in Kermani sheep [مقاله ژورنالی]
  • Tohidi, R., I.B. Idris, J.M. Panandam and M. Hair-Bejo. ۲۰۱۳. ...
  • Tohidi, R., I.B. Idris, J.M. Panandam and M.H. Hair-Bejo. ۲۰۱۲. ...
  • Thomas, N. and S. Joseph. ۲۰۱۲. Role of SLC۱۱A۱ gene ...
  • Vanhala, T., M. Tuiskula-Haavisto, K. Elo, J. Vilkki and A. ...
  • Weir, B.S. ۱۹۹۰. Genetic data analysis: Methods for discrete population ...
  • Yeh, F.C., Y. Rongcal and T. Boyle. ۲۰۰۰. POPGENE ۱.۳۲: ...
  • Zamani, P., M. Akhondi, M.R. Mohammadabadi, A.A. Saki, A. Ershadi, ...
  • Zandi, E., M.R. Mohammadabadi, M. Ezzatkhah and A.K. Esmailizadeh. ۲۰۱۴. ...
  • Zanetti, E., C. Dalvit, M. De Marchi, R. Dal Zotto ...
  • Zhou, H. and S.J. Lamont. ۲۰۰۳. Association of six candidate ...
  • Zhou, H., A. Buitenhuis, S. Weigend and S. Lamont. ۲۰۰۱. ...
  • Al-Atiyat, R. ۲۰۱۰. Genetic diversity of indigenous chicken ecotypes in ...
  • Alinaghizadeh, H., M.R. Mohammad Abadi and S. Zakizadeh. ۲۰۱۰. Exon ...
  • Allendorf, F.W. and R.F. Leary. ۱۹۸۶. Heterozygosity and fitness in ...
  • Bulumulla, P.B.A.I.K., P. Silva and H. Jianlin. ۲۰۱۱. Genetic diversity ...
  • Corander, J., P. Waldmann and M.J. Sillanpää. ۲۰۰۳. Bayesian analysis ...
  • Estess, P., A. Nandi, M. Mohamadzadeh and M.H. Siegelman. ۱۹۹۹. ...
  • Hemati, B., M.H. Banabazi, S. Shahkarami, E. Mohandesan and P. ...
  • Jaiswal, G., S. Kumar, Y. Prasad and D.P. Singh. ۲۰۰۹. ...
  • Javanmard, A., M.R. Mohammadabadi, G.E. Zarrigabayi, A.A. Gharahedaghi, M.R. Nassiry, ...
  • Keller, L.F. and D.M. Waller. ۲۰۰۲. Inbreeding effects in wild ...
  • Kogut, M., L. Rothwell and P. Kaiser. ۲۰۰۳. Priming by ...
  • Köllisch, G., B.N. Kalali, V. Voelcker, R. Wallich, H. Behrendt, ...
  • Kumar, R., S. Kumar, D.P. Singh and P. Gaur. ۲۰۰۷. ...
  • Levene, H. ۱۹۴۹. On a matching problem in genetics. The ...
  • Leveque, G., V. Forgetta, S. Morroll, A.L. Smith, N. Bumstead, ...
  • Maghsoudi, S.M. and A. Pakdel. ۲۰۰۸. Review of effective genetical ...
  • McDonald, D.G. and J. Dimmick. ۲۰۰۳. The conceptualization and measurement ...
  • Miller, S.A., D.D. Dykes and H.F. Polesky. ۱۹۸۸. A simple ...
  • Moazeni, S., M.R. Mohammadabadi, M. Sadeghi, H. Shahrbabak, A. Koshkoieh ...
  • Association of the melanocortin-3(MC3R) receptor gene with growth and reproductive traits in Mazandaran indigenous chicken [مقاله ژورنالی]
  • Mohammadabadi, M.R., M. Nikbakhti, H.R. Mirzaee, A. Shandi, D.A. Saghi, ...
  • Mohammadi, A., M.R. Nassiry, J. Mosafer, M.R. Mohammadabadi and G.E. ...
  • Mohammadifar, A. and M.R. Mohammadabadi. ۲۰۱۱. Application of microsatellite markers ...
  • Mousavizadeh, A., M.R. Mohammadabadi, A. Torabi, M.R. Nassiry, H. Ghiasi ...
  • Nei, M. ۱۹۷۳. Analysis of gene diversity in subdivided populations. ...
  • Nikoubin Borujeni, M., N. Pirany and F. Rafiei Boroujeni. ۲۰۱۶. ...
  • Ramasamy, K.T., M.R. Reddy and S. Murugesan. ۲۰۱۱. Toll-like receptor ...
  • Association of growth trait and Leptin gene polymorphism in Kermani sheep [مقاله ژورنالی]
  • Tohidi, R., I.B. Idris, J.M. Panandam and M. Hair-Bejo. ۲۰۱۳. ...
  • Tohidi, R., I.B. Idris, J.M. Panandam and M.H. Hair-Bejo. ۲۰۱۲. ...
  • Thomas, N. and S. Joseph. ۲۰۱۲. Role of SLC۱۱A۱ gene ...
  • Vanhala, T., M. Tuiskula-Haavisto, K. Elo, J. Vilkki and A. ...
  • Weir, B.S. ۱۹۹۰. Genetic data analysis: Methods for discrete population ...
  • Yeh, F.C., Y. Rongcal and T. Boyle. ۲۰۰۰. POPGENE ۱.۳۲: ...
  • Zamani, P., M. Akhondi, M.R. Mohammadabadi, A.A. Saki, A. Ershadi, ...
  • Zandi, E., M.R. Mohammadabadi, M. Ezzatkhah and A.K. Esmailizadeh. ۲۰۱۴. ...
  • Zanetti, E., C. Dalvit, M. De Marchi, R. Dal Zotto ...
  • Zhou, H. and S.J. Lamont. ۲۰۰۳. Association of six candidate ...
  • Zhou, H., A. Buitenhuis, S. Weigend and S. Lamont. ۲۰۰۱. ...
  • نمایش کامل مراجع