مطالعه تغییرات بیان Pdu-miR۳۱۹a، Pdu-miR۳۹۸a و ژن های هدف آن ها در اندام های زایشی بادام تحت تنش سرما

سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 322

فایل این مقاله در 22 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-13-1_005

تاریخ نمایه سازی: 11 مرداد 1400

چکیده مقاله:

درخت بادام به دلیل نیاز سرمایی کم، به سرمای دیررس بهاره حساس بوده و همه ساله متحمل خسارات جبران ناپذیری توسط این تنش می شود. لازمه توسعه ارقام متحمل با استفاده از روش های مهندسی ژنتیک، شناخت مکانیسم های مولکولی دخیل در پاسخ گیاه به تنش سرما می باشد. در مطالعات اخیر نقش مهم RNAهای کوچک به ویژه میکروRNAها در پاسخ و سازگاری گیاهان به تنش های زیستی و غیر زیستی اثبات شده است. از این رو بر اساس نتایج توالی یابی sRNAهای بادام از میان میکروRNAهای پاسخ دهنده به تنش سرما، در این مطالعه Pdu-miR۳۱۹a و Pdu-miR۳۹۸a-۳p انتخاب و الگوی بیان آن ها به همراه ژن هدفشان در بین دو ژنوتیپ متحمل و حساس به سرمای بادام تحت تنش سرما مورد مقایسه قرار گرفتند. مواد و روش ها: در این آزمایش بافت های زایشی بساک و تخمدان ژنوتیپ متحمل H و رقم حساس به سرمای Sh۱۲ تحت تیمارهای صفر و ۲- درجه سانتی گراد قرار گرفتند. پس از استخراج RNA و سنتز cDNA، واکنش Real time PCR انجام و تجزیه و تحلیل داده های بیان نیز با استفاده از روش ΔΔct ۲- صورت گرفت. نتایج: ژن miR۳۱۹a با اثر تنظیمی مثبت در پاسخ به هر دو سطح تنش سرما در هر دو ژنوتیپ شناسایی گردید. کاهش بیان GAMYB-like در هر دو بافت زایشی ژنوتیپ H در پاسخ به تنش صفر درجه سانتی گراد و نیز در بافت تخمدان Sh۱۲ در پاسخ به هر دو سطح تنش مشاهده شد. ژن TCP۴ در ژنوتیپ H در پاسخ به هر دو سطح تنش افزایش معنی داری را نشان داد. MiR۳۹۸a-۳p با اثر تنظیمی منفی در ژنوتیپ H شناسایی شد. اما افزایش بیان ژن CTR۶ در هر دو بافت در پاسخ به تنش ۲- درجه سانتی گراد مشاهده گردید. در رقم Sh۱۲ افزایش بیان miR۳۹۸a-۳p و کاهش بیانCTR۶ در بافت تخمدان Sh۱۲ در پاسخ به تنش ۲- درجه سانتی گراد مشاهده شد. نتیجه گیری: با توجه به مشاهده افتراق بیان ژن های مورد مطالعه در بین دو ژنوتیپ متحمل و حساس، به منظور تکمیل اطلاعات مولکولی در رابطه با عملکرد آن ها، توصیه می شود بیان آن ها در سایر ارقام متحمل و حساس و تحت تیمار های مختلف تنش سرمایی نیز سنجیده شود و به دنبال آن عملکرد آن ها با استفاده از روش هایی نظیر بیش بیان کردن ژن ها، تکنولوژی amiRNA و روش target mimicry بررسی گردد.

نویسندگان

مرضیه کریمی

شهرکرد- دانشگاه شهرکرد-دانشکده کشاورزی -گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی

بهروز شیران

شهرکرد-دانشگاه شهرکرد- دانشکده کشاورزی- گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی

محمد ربیعی

استادیار، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد

حسین فلاحی

گروه زیست شناسی، دانشکد ه علوم، دانشگاه رازی کرمانشاه

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • احسنی محمدرضا؛ محمدآبادی محمدرضا؛ اسدی فوزی و همکاران (۱۳۹۸) بیان ...
  • ایمانی علی (۱۳۷۹). اصلاح بادام (ترجمه). نشر آموزش کشاورزی. ۱۲۸ ...
  • توحیدی نژاد فاطمه؛ محمدآبادی محمدرضا؛ اسمعیلی زاده کشکوئیه علی؛ نجمی ...
  • بررسی بیان ژن CIB4 در بافت های مختلف گوسفند کرمانی با استفاده از Real Time qPCR [مقاله ژورنالی]
  • سرخه کریم (۱۳۹۰) بررسی فیزیو بیو شیمیایی و مولکولی گونه ...
  • محمدآبادی محمدرضا؛ کرد محبوبه؛ نظری محمود (۱۳۹۷) مطالعه بیان ژن ...
  • موسوی صادق؛ شیران بهروز؛ ایمانی علی؛ هوشمند سعداله؛ ابراهیمی اسماعیل ...
  • ReferencesAbla M, Sun H, Li Z et al. (۲۰۱۹) Identification ...
  • Achard P, Gong F, Cheminant S et al. (۲۰۰۸) The ...
  • Afshari H, Parvane T( ۲۰۱۳) Study the effect of cold ...
  • Ahsani MR, Mohammadabadi MR, Asadi Fozi M et al. (۲۰۱۹a) ...
  • Ahsani MR, Mohammadabadi MR, Asadi Fozi M et al. (۲۰۱۹b) ...
  • Alisoltani A, Shiran B, Fallahi H, Ebrahimie E ( ۲۰۱۵) ...
  • Bellemare DR, Shaner L, Morano et al. (۲۰۰۲) Ctr۶, a ...
  • Chen C, Ridzon DA, Broomer AJ et al. (۲۰۰۵) Real-time ...
  • Chen Y, Jiang J, Song A et al. (۲۰۱۳) Ambient ...
  • Dai X, Zhao, PX (۲۰۱۱). psRNATarget: a plant small RNA ...
  • Dhanapal AP, Crisosto CH (۲۰۱۳) Association genetics of chilling injury ...
  • Gao X, Wan F, Mateo K et al. (۲۰۰۹) Bacterial ...
  • Gubler F, Kalla R, Roberts JK, Jacobsen JV (۱۹۹۵) Gibberellin-regulated ...
  • He L, Hannon GJ (۲۰۰۴) MicroRNAs: small RNAs with a ...
  • Imani A, Mahamadkhani Y (۲۰۱۱) Characteristics of almond selections in ...
  • Imani A, Ezaddost M, Asgari F, Masoumi S, Raeisi I ...
  • Jafari Darehdor AH, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh AK, Riahi Madvar A ...
  • Jia X, Wang WX, Ren L et al. (۲۰۰۹) Differential ...
  • Jones-Rhoades MW, Bartel DP (۲۰۰۴) Computational identification of plant microRNAs ...
  • Karimi M, Ghazanfari F, Fadaei A et al. (۲۰۱۶) The ...
  • Liu HH, Tian X, Li YJ, Wu CA, Zheng CC ...
  • Livak KJ, Schmittgen TD (۲۰۰۱) Analysis of relative gene expression ...
  • Lv DK, Bai X, Li Y et al. (۲۰۱۰) Profiling ...
  • Mallory AC, Dugas DV, Bartel DP, Bartel B (۲۰۰۴) MicroRNA ...
  • Millar AA, Gubler F (۲۰۰۵) The Arabidopsis GAMYB-like genes, MYB۳۳ ...
  • Millar AA, Lohe A, Wong G (۲۰۱۹) Biology and Function ...
  • Mohammadabadi MR, Tohidinejad F (۲۰۱۷) Charachteristics determination of Rheb gene ...
  • Mohammadabadi MR, Jafari AHD, Bordbar F (۲۰۱۷) Molecular analysis of ...
  • Mohammadabadi MR, Kord M, Nazari M (۲۰۱۸) Studying expression of ...
  • Mousavi S, Alisoltani A, Shiran B, et al. (۲۰۱۴) De ...
  • Mukhopadhyay P, Tyagi AK (۲۰۱۵) OsTCP۱۹ influences developmental and abiotic ...
  • Reyes JC, Muro-Pastor MI, Florencio FJ (۲۰۰۴) The GATA family ...
  • Rhoades MW, Reinhart BJ, Lim LP et al. (۲۰۰۲). Prediction ...
  • Rubio-Piña JA, Zapata-Pérez O (۲۰۱۱) Isolation of total RNA from ...
  • Schwab R, Ossowski S, Riester M et al. (۲۰۰۶). Highly ...
  • Sinha S, Kukreja B, Arora P et al. (۲۰۱۵) The ...
  • Sunkar R, Zhu JK ( ۲۰۰۴) Novel and stress-regulated microRNAs ...
  • Thiebaut F, Rojas CA, Almeida KL, et al ( ۲۰۱۲) ...
  • Tohidi nezhad F, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh AK, Najmi Noori A ...
  • Varkonyi-Gasic E, Wu R, Wood M et al (۲۰۰۷). Protocol: ...
  • Wang B, Duan CG, Wang X et al. (۲۰۱۵). HOS۱ ...
  • Wang T, Pan H, Wang J, Yang W, Cheng T, ...
  • Yamasaki H Abdel-Ghany SE, Cohu CM (۲۰۰۷) Regulation of copper ...
  • Yang Y, Zhang X, Su Y, (۲۰۱۷) miRNA alteration is ...
  • Yang C, Li D, Mao D, Liu (۲۰۱۳) Overexpression of ...
  • Yu X, Wang H, Lu Y et al. (۲۰۱۲) Identification ...
  • Zeng X, Xu Y, Jiang J et al. (۲۰۱۸) Identification ...
  • Zhang B, Pan X, Cobb GP (۲۰۰۶) Anderson TA. Plant ...
  • Zhou B, Kang Y, Leng J, Xu Q (۲۰۱۹) Genome-Wide ...
  • Zhu C, Ding Y, Liu H (۲۰۱۱) MiR۳۹۸ and plant ...
  • نمایش کامل مراجع