ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
ورود |عضویت رایگان |راهنمای سایت |عضویت کتابخانه ها
عنوان
مقاله

آنالیز بیوانفورماتیکی تاثیر Linalool تشنه داری(Scrophularia striata) بر پروتئین VacA هلیکوباکتر پیلوری

سال انتشار: 1400
کد COI مقاله: JR_SHIMU-29-1_006
زبان مقاله: فارسیمشاهده این مقاله: 47
فایل این مقاله در 15 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

خرید و دانلود فایل مقاله

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای 15 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

مشخصات نویسندگان مقاله آنالیز بیوانفورماتیکی تاثیر Linalool تشنه داری(Scrophularia striata) بر پروتئین VacA هلیکوباکتر پیلوری

بهمن فاضلی نسب - ۱Research Department of Agronomy and Plant Breeding, Agricultural Research Institute, University of Zabol, Zabol, Iran, ZIP; ۹۸۶۱۳۳۵۸۵۶, TellFax; +۹۸-۵۴۳۲۲۴۰۶۹۶

چکیده مقاله:

مقدمه: برخی گیاهان ازجمله تشنه­داری، به طور سنتی در میان مردم زاگرس نشین، به عنوان التیام بخش عفونت و زخم استفاده می­شده است. در تحقیقات پیشین، اثر التیام بخشی عصاره آبی و هیدروالکلی آن بر استرس اکسیداتیو و درمان زخم معده ناشی از اتانول در موش صحرایی تائید شده است. بر اساس این، هدف از تحقیق حاضر، آنالیز بیوانفورماتیکی تاثیر Linalool (یکی از بیشترین اجزای تشنه­داری) بر مهار پروتئین VacA هلیکوباکتر پیلوری است. مواد و روش ها: توالی­های DNA و پروتئینی Linalool گیاه آرابیدوپسیس و توالی ژن VacA هلیکوباکتر پیلوری از سراچه NCBI تهیه شد. میزان هم ردیفی توالی های DNA و پروتئینی Linalool و VacA توسط نرم افزار Clustalw vol.۲  بررسی و موتیف­های حفاظت شده با استفاده از برنامه MEME جستجو گردید. درخت فیلوژنی به وسیله نرم­افزار MEGA vol.۵ ترسیم شد. برای تعیین ساختار سوم و همچنین داکینگ مولکولی بر اساس همولوژی، توسط نرم افزار Swiss-Model و ESYPred۳D و همچنین Galaxy Web صورت گرفت. یافته های پژوهش: پروتئین های لینالول گزارش شده در سراچه NCBI، در بیشتر گیاهان، سه موتیف حفاظت شده (در محدوده ۱۰۰ تا ۳۰۰ اسید آمینه) دارد. پروتئین VacA هر سه نوع دومین سیتوپلاسمی، غشایی و کینازی را داراست. بهترین الگوی داکینگ مولکولی بر اساس بیشترین اثر متقابل میان پروتئین لینالول و پروتئین VacA (۰/۲۱) و بیشترین دقت (۱۳۳/۰) انتخاب شد. نتایج نشان داد که در ساختار هر دو پروتئین لینالول و VacA، گروه های گوناگونی ازجمله گروه های آلیفاتیک (چربی)، قطبی و آب دوست داشت. حضور چربی و آب دوست بودن در پروتئین VacA، به آن این قابلیت را می دهد که بتواند در صورت تجزیه نشدن، توسط سلولی های لنفوسیت، به راحتی از غشای سلول ها عبور کند و سبب بیماری زایی شود. از سویی، حضور همین گروه ها در لینالول نیز عاملی است که توانسته است پروتئین VacA را مهار کند. بحث و نتیجه گیری: آنالیز بیوانفورماتیکی نشان داد که لینالول سبب از میان بردن آثار هلیکوباکتر پیلوری می­شود؛ همچنین نتایج پژوهش حاضر می تواند به عنوان پایه ای برای تحقیقات آینده، برای ارزیابی تاثیر تک­تک مواد موثر تشنه­داری به ویژه لینالول، بر باکتری هلیکوباکتر پیلوری استفاده شوند.

کلیدواژه ها:

Gastric cancer, Molecular docking, Scrophularia striata, VacA protein, داکینگ مولکولی, گل میمون سازویی, پروتئین VacA, سرطان معده

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

کد یکتای اختصاصی (COI) این مقاله در پایگاه سیویلیکا JR_SHIMU-29-1_006 میباشد و برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/1240672/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
فاضلی نسب، بهمن،1400،آنالیز بیوانفورماتیکی تاثیر Linalool تشنه داری(Scrophularia striata) بر پروتئین VacA هلیکوباکتر پیلوری،https://civilica.com/doc/1240672

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1400، فاضلی نسب، بهمن؛ )
برای بار دوم به بعد: (1400، فاضلی نسب؛ )
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :

  • Signal V, Gurney J, Inns S, McLeod M, Sika-Paotonu D, ...
  • De Bruyne E, Ducatelle R, Foss D, Sanchez M, Joosten ...
  • Mehrabi A-A, Fazeli-Nasab B. In vitro culture of Allium scorodoprasum ...
  • Fazeli-Nasab B. The effect of explant, BAP and ۲,۴-D on ...
  • Rezaei-Nasab M, Komeili G, Fazeli-Nasab B. Gastroprotective effects of aqueous ...
  • Fazeli-Nasab B. Biological Evaluation of Coronaviruses and the Study of ...
  • Amiri H, H. L-Y, Esmaeili A, Samsamnia F, Eghbali D, ...
  • Shoohani B, Hemati AA, Taheri Moghadam M. Effects of Scrophularia ...
  • Babri S, Doosti MH, Fatehi L, Salari AA. The effects ...
  • Azadmehr A, Alizadeh-Oghyanous K, Hajiaghaee R, Amirghofran Z, Azadbakht M. ...
  • Azhdari-Zarmehri H, Nazemi S, Ghasemi E, Musavi Z, Tahmasebi Z, ...
  • Havasyan M, Panahi J, Pakzad A, Davoudian A, Jalilian A, ...
  • Tandon M, Srivastava R, Nagpal R, Khosla P, Singh J. ...
  • Samini M, Dehpour A, Babazadeh K. Study of efffect of ...
  • Bailey TL, Gribskov M. Combining evidence using p-values: application to ...
  • Bas E, Recio MC, Máñez S, Giner RM, Escandell JM, ...
  • Stevenson PC, Simmonds MS, Sampson J, Houghton PJ, Grice P. ...
  • Mortimer P, Burnand K, Champion R, Burton J, Burns D, ...
  • Diaz AMa, Abad MaJ, Fernández L, Silván AM, De Santos ...
  • Fernández MA, Garcia M, Saenz M. Antibacterial activity of the ...
  • Giner R-Ma, Villalba Ma-L, Recio Ma-C, Máñez S, Cerdá-Nicolás M, ...
  • Moezzi N, Varzi H, Shirali S. Comparing the effect of ...
  • Shakibaie D, Pasharavesh L, Khoshboo S, Kaboodi B. The Effect ...
  • Hafezi F, Elmirad H, Pedram MS. Determination of the Macroscopic ...
  • Pakbaz Z, Shirazi MH, Pourman MR, Ranjbar R, Hoseini M, ...
  • مدیریت اطلاعات پژوهشی

    صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم
    این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

    اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

    علم سنجی و رتبه بندی مقاله

    مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
    نوع مرکز: دانشگاه دولتی
    تعداد مقالات: 6,437
    در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

    به اشتراک گذاری این صفحه

    اطلاعات بیشتر درباره COI

    COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

    کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

    پشتیبانی