بررسی نقش احتمالی BAX Inhibitor ۱ در تحمل به شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 226

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ESCS-13-3_018

تاریخ نمایه سازی: 23 خرداد 1400

چکیده مقاله:

تنش شوری یکی از مهمترین عوامل کاهش عملکرد گیاهان زراعی در سراسر جهان می باشد. مرگ سلولی برنامه ریزی شده نقش مهمی در سازگاری به تنش های محیطی ایفا می کند. درک مبانی مولکولی مکانیسم این فرآیند، امکان دستورزی ژنتیکی هدفمند گیاهان در جهت تحمل به تنش های محیطی را فراهم می کند. یک تنظیم کننده کاندید برای چنین مکانیسمی BAX Inhibitor ۱ است. در این پژوهش، نقش احتمالی ژن رمز کننده BAX Inhibitor ۱-like protein در تحمل به تنش شوری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی از قبیل آنالیز پروموتر و شبکه تنظیمی ژنی و همچنین بررسی بیان نسبی ژن در شاخساره رقم مقاوم ارگ، رقم حساس الموت و خویشاوند وحشی Aegilops crassa با استفاده از Real-time PCR مورد ارزیابی قرار گرفته است. با توجه به آنالیز شبکه تنظیمی، احتمالا این ژن در بالادست مسیر پیام رسانی SOS عمل می کند. بر اساس آنالیز پروموتر وجود موتیف های پاسخ به تنش از جمله موتیف های ABRE (پاسخ دهنده به آبسزیک اسید)، LTR(پاسخ دهنده به دمای پایین)، MBS (پاسخ دهنده به خشکی)، CGTCA-motif (پاسخ دهنده به متیل جاسمونات)، TGACG-motif (پاسخ دهنده به متیل جاسمونات)، ERE (پاسخ دهنده به اتیلن)، و GT-۱ motif (عنصر پاسخ به شوری) تائیدی بر نقش این ژن در تنش های مختلف محیطی از جمله شوری می باشد. همچنین الگوی بیان ژن مورد مطالعه تحت تنش شوری بین ژنوتیپ های مقاوم و حساس اختلاف معنی داری داشت. در مجموع چنین نتیجه گیری می شود که ژن رمز کننده این پروتئین می تواند در القای تحمل به شوری در گندم نقش داشته باشد و جهت دستورزی ژنتیکی با هدف بهبود تحمل به تنش مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه ها:

پروموتر ، تنش شوری ، شبکه تنظیمی ، گندم ، BAX Inhibitor ۱-like protein

نویسندگان

زهرا زینتی

استادیار بخش اگرواکولوژی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی داراب

عباس عالم زاده

دانشیار بخش زراعت و اصلاح نبات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

علی نیازی

استاد مرکز بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

اسماعیل ابراهیمی

استاد مرکز بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Ahn, T., Yun, C.H., Chae, H.Z., Kim, H.R., Chae, H.J., ...
  • Asadi, M., Mohammadi-Nejad, G., Golkar, P., Naghavi, H., Nakhoda, B. ...
  • Babaeizad, V., Imani, J., Kogel, K.H., Eichmann, R., Huckelhoven, R., ...
  • Cai, Y.M., Yu, J., Gallois, P., ۲۰۱۴. Endoplasmic reticulum stress-induced ...
  • Cazalis, R., Pulido, P., Aussenac, T., Perez-Ruiz, J.M., Cejudo, F.J., ...
  • Chae, H.J., Kim, H.R., Xu, C., Bailly-Maitre, B., Krajewska, M., ...
  • Chae, H.J., Kim, H.R., Xu, C., Bailly-Maitre, B., Krajewska, M., ...
  • Chandran, D., Tai, Y.C., Hather, G., Dewdney, J., Denoux, C., ...
  • Demaurex, N., Distelhorst, C., ۲۰۰۳. Cell biology. Apoptosisthe calcium connection. ...
  • Duan, Y., Zhang, W., Li, B., Wang, Y., K. Li, ...
  • Eichmann, R., Schultheiss, H., Kogel, K.H., Huckelhoven, R., ۲۰۰۴. The ...
  • Finkemeier, I., Goodman, M., Lamkemeyer, P., Kandlbinder, A., Sweetlove, L.J., ...
  • Frohlich, K.U., Fussi H., Ruckenstuhl, C., ۲۰۰۷. Yeast apoptosis from ...
  • Greenberg, J.T., Yao, N., ۲۰۰۴. The role and regulation of ...
  • Hajnoczky, G., Davies, E., Madesh, M., ۲۰۰۳. Calcium signaling and ...
  • Higo, k., Ugawa, Y., Lwamoto, M., Korenaga, T., ۱۹۹۹. Plant ...
  • Hosseinpour, B, Hajihoseini, V., Kashfi, R., Ebrahimi, E., Hemmatzadeh, F., ...
  • Huckelhoven, R., ۲۰۰۴. BAX Inhibitor-۱, an ancient cell death suppressor ...
  • Huckelhoven, R., Dechert, C., Kogel, K.H., ۲۰۰۳. Overexpression of barley ...
  • Huh, G.H., Damsz, B., Matsumoto, T.K., Reddy, M.P., Rus, A.M., ...
  • Isbat, M., Zeba, N., Kim, S.R., Hong, C.B., ۲۰۰۹. A ...
  • Ji, H., Pardo, J.M., Batelli, G., Van Oosten, M.J., Bressan, ...
  • Jin, C., Reed, J.C., ۲۰۰۲. Yeast and apoptosis. Nature Reviews ...
  • Kawai-Yamada, M., Ohori Y., Uchimiya, H., ۲۰۰۴. Dissection of Arabidopsis ...
  • Kerepesi I, Galiba, G., ۲۰۰۰. Osmotic and salt stress-induced alteration ...
  • Kim, H.R., Lee, G.H., Cho, E.Y., Chae, S.W., Ahn, T., ...
  • Lacomme, C., Santa Cruz, S., ۱۹۹۹. Bax-induced cell death in ...
  • Lam, E., ۲۰۰۸. Programmed cell death in plants: Orchestrating an ...
  • Lescot, M., Déhais, P., Thijs, G., Marchal, K., Moreau, Y., ...
  • Liu, C.G., Wu, Y.W., Hou, H., Zhang, C., Zhang, Y., ...
  • Liu, Y., Xiong Y., Bassham D.C., ۲۰۰۹. Autophagy is required ...
  • Matsumura, H., Nirasawa, S., Kiba, A., Urasaki, N., Saitoh, H., ...
  • Niazi, A., Ramezani, A., Dinari, A., ۲۰۱۴. GSTF۱ gene expression ...
  • Ozgur, R., Uzilday, B., Iwata, Y., Koizumi, N., Turkan, I., ...
  • Patil, C., Walter, P., ۲۰۰۱. Intracellular signaling from the endoplasmic ...
  • Pfaffl, M.W., ۲۰۰۱. A new mathematical model for relative quantification ...
  • Sanchez, P., de Torres Zabala, M., Grant, M., ۲۰۰۰. AtBI-۱, ...
  • Subbaiah, C.C., Sachs, M.M., ۲۰۰۳. Molecular and cellular adaptations of ...
  • Vignols, F., Brehelin, C., Surdin-Kerjan, Y., Thomas, D., Meyer, Y., ...
  • Wang, X., Tang, C., Huang, X., Li, F., Chen, X., ...
  • Watanabe, N., Lam, E., ۲۰۰۶. Arabidopsis Bax inhibitor-۱ functions as ...
  • Watanabe, N., Lam, E., ۲۰۰۸. BAX inhibitor-۱ modulates endoplasmic reticulum ...
  • Watanabe, N., Lam, E., ۲۰۰۹. Bax inhibitor-۱, a conserved cell ...
  • Wittkopp, P. J., Kalay, G., ۲۰۱۱. Cis-regulatory elements: molecular mechanisms ...
  • Xie, Y.J., Xu, S., Han, B., Wu, M.Z., Yuan, X.X., ...
  • Xu, G., Wang, S., Han, S., Xie, K., Wang, Y., ...
  • Xu, Q., Reed, J.C., ۱۹۹۸. Bax inhibitor-۱, a mammalian apoptosis ...
  • Zinati, Z., Alemzadeh, A., Ebrahimie, E., Niazi, A., ۲۰۱۴. Study ...
  • نمایش کامل مراجع