سنجش نسبت بیان HOXB۱۳:IL۱۷BR در بیماران مبتلا به سرطان پستان به روش qRT-PCR با استفاده از رنگ سایبرگرین

زمینه و هدف: مطالعات نشان داده اند نسبت بیان HOXB۱۳:IL۱۷BR، شاخص پیشگویی پیامدهای کلینیکی در بیماران مبتلا به سرطان پستان با تومورهای استروژن رسپتور مثبت و عدم درگیری غدد لنفاوی تحت درمان با تاموکسیفن است. تمام این آزمایشات با روش qReal Time RT-PCR با استفاده از پروب TaqMan انجام شدند. هدف پژوهش حاضر سنجش این نسبت با روش qReal Time RT-PCR با استفاده از سایبرگرین بود. روش بررسی: در این مطالعه ی مورد- شاهدی، نسبت بیان HOXB۱۳:IL۱۷BR در ۴۰ نمونه ی توموری و غیرتوموری پارافینه شده سرطان پستان مورد بررسی قرار گرفت. پس از استخراج RNA از بافت ها و سنتز cDNA و تکثیر توالی مورد نظر توسط واکنش زنجیره ای پلیمراز و به دست آوردن دمای بهینه برای هر ژن، جهت سنجش بیان از روش qReal Time RT-PCR استفاده شد و رنگ سایبرگرین I به عنوان نشانگر مورد استفاده قرار گرفت. سطح بیان ژن های هدف با استفاده از میانگین هندسی سطح بیان ژن های خانه داری توسط نرم افزار BestKeeper به دست آمد و نرمال سازی شد. مقایسه میانگین بیان ژن بین نمونه های توموری و غیرتوموری با استفاده از آزمون t-test انجام شد و مقایسه رابطه بین گروه ریسک بالا/پایین و دارا بودن/نبودن علایم بیماری با استفاده از آزمون Fisher`s Exact test انجام شد. یافته ها: میانگین نسبت بیان HOXB۱۳:IL۱۷BR در نمونه های توموری با نمونه های نرمال از نظر آماری تفاوت معنی داری نشان نداد. نتایج مطالعه نشان داد که بین قرار گرفتن یک فرد بیمار در ۲ گروه ریسک بالا و پایین (بر اساس میانگین نسبت بیان ۲ ژن HOXB۱۳:IL۱۷BR)، با عود بیماری در آینده ارتباط مستقیم و معنی داری وجود دارد. نتیجه گیری: نتایج در مطالعه حاضر نشان داد، علی رغم جایگزینی رنگ سایبرگرین با پروب، همچنان بین نسبت بیان HOXB۱۳:IL۱۷BR و زندگی با علائم بیماری رابطه معنی داری وجود دارد

کلیدواژه ها:

Breast Cancer ، HOXB۱۳ ، IL۱۷BR ، qReal Time RT-PCR ، SYBR Green I. ، سرطان پستان ، ژن HOXB۱۳ ، ژن IL۱۷BR ، qReal Time RT-PCR ، سایبرگرین I