ارزیابی تنوع ژنتیکی پنج گونه جنس Fraxinus با نشانگرهای کلروپلاستی

سال انتشار: 1399
محل انتشار: پنجمین همایش ملی تنوع زیستی و تاثیر آن بر کشاورزی و محیط زیست
کد COI اختصاصی: NSBDIAE05_072
زبان مقاله: فارسی
تعداد مشاهده: 512

نویسندگان

استادیار پژوهشی، دکترای تخصصی اصلاح نباتات، بخش تحقیقات زیست فناوری، موسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران

فرزاد بنائی اصل

استادیار پژوهشی، دکترای تخصصی اصلاح نباتات، بخش تحقیقات زیست فناوری، موسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران

شیوا قیطران پور سهریق

دانشجوی دکترای اصلاح نباتات، گروه بهنژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران

چکیده

شناسایی گونه های یک جنس از طریق مورفولوژی گیاه همواره با خطا همراه است. استفاده از نشانگرهای کلروپلاستی نقش مهمی در تمایز گونه ها دارد. بنابراین شناسایی گونه های مختلف جنس ون با استفاده از توالی های کلروپلاستی هدف گذاری شده است. توالی پنج گونه ون از داده پایگاه NCBI دانلود و پس از همردیفی چند گانه توالیها، تشکیل ماتریس فاصله انجام و ترسیم درخت فیلوژنتیکی با استفاده از کل توالی ژنومی و نواحی SSC LSC و IR با نرم افزار MEGA۷ صورت گرفت. درخت فیلوژنتیکی حاصل از آنالیز فیلوژنتیکی با روش های حداکثر درست نمایی و اتصال همسایه، سه کلاد کاملا مشخص را نشان داد که پنج گونه ون از همدیگر به طور واضح تمایز یافتند. نتایج نشان داد که کل طول ژنوم و ناحیه LSC و SSC توانایی لازم برای تمایز پنج گونه مختلف ون را دارند.

کلیدواژه ها

آنالیز فیلوژنتیکی، ون، ژنوم کلروپلاستی، MEGA۷

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.