پیش بینی تعاملات پروتئینی به کمک شبکه عصبی خود رمزگذار متغیر و جنگل تصادفی
- سال انتشار: 1399
- محل انتشار: اولین کنفرانس مهندسی و فن آوری
- کد COI اختصاصی: NCOEI01_114
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 600
نویسندگان
دانشجو کارشناسی ارشد مهندسی کامپیوتر-نرمافزار دانشگاه تربیت دبیر شهید رجایی، ایران، تهران
عضو هیئت علمی، استادیار گروه مهندسی کامپیوتر-نرمافزار دانشگاه تربیت دبیر شهید رجایی، ایران، تهران
چکیده
تعاملات پروتئین-پروتئین نقشی کلیدی در بیوشیمی ایفا میکنند چراکه عملکردهای بیولوژیکی نتیجه فعلوانفعالات میان اجزای سلولی مولکولی است. ازاینرو درک مکانیسم های رفتاری و عملکردی نیاز به بررسی کامل تعاملات فیزیکی میان پروتئینها دارد.کشف ارتباط میان پروتئینها در شبکه های زیستی مانند شبکه های متابولیکی، برای انجام تحقیقات مربوطه در محیط آزمایشگاه نیازمند صرف وقت و هزینه بسیار زیاد میباشد. از روشهای محاسباتی موجود تکنیکهای تعبیه گره و شبکه روشی محبوب برای تولید ویژگیها، حذف نویز و پیشبینی دقیق هستند و به یکی از متداول ترین روشها در زیست شناسی محاسباتی تبدیل شده اند. در این مقاله به کمک شبکه عصبی خود رمزگذار متغیر و الگوریتم جنگل تصادفی رویکردی نوین مبتنی بر تعبیه سازی گره برای پیشبینی تعاملات پروتئینی ارائه شده است. آزمایشات صورت گرفته بر روی مجموعه داده های معتبر مختلف نشاندهنده این موضوع است که روش پیشنهادی عملکرد مناسبی ازلحاظ دقت و سرعت دارد و نتایج به مراتب بهتری نسبت به روشهای مشابه دارد.کلیدواژه ها
پیشبینی تعاملات پروتئینی، پیشبینی پیوند، تعبیه سازی گره، یادگیری عمیقمقالات مرتبط جدید
- تحلیل چالشها و راهکارهای تقویت ارتباط دانشگاه و صنعت: با تمرکز بر حلقههای مفقوده
- بازخوانی نقش دانشگاه و صنعت در توسعه ملی: از موانع تا راهکارها
- نشانگر تشخیصی جدید در ژن C-myc به عنوان کیت غیر تهاجمی تشخیص سرطان دهان
- برنامه ریزی منابع تجدید پذیر با درنظر گرفتن برنامه ریزی توسعه انتقال و تولید منابع توان راکتیو
- برنامه ریزی همزمان توسعه انتقال و منابع تولید توان راکتیو با استفاده از یک الگوریتم تکاملی بهبود یافته
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.